Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC159P0C7I6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC159P0C7I6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC159P0C7I6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC159P0C7I6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC159P0C7I6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC159P0C7I6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC159P0C7I6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC159P0C7I6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC159P0C7I6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC159P0C7I6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC159P0C7I6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC159P0C7I6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC159P0C7I6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC159P0C7I6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC159P0C7I6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC159P0C7I6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC159P0C7I6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC159P0C7I6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC159P0C7I6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC159P0C7I6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC159P0C7I6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC159P0C7I6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC159P0C7I6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC159P0C7I6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC159P0C7I6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC159P0C7I6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC159P0C7I6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC159P0C7I6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC159P0C7I6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC159P0C7I6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC159P0C7I6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC159P0C7I6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC159P0C7I6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC159P0C7I6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC159P0C7I6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC159P0C7I6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC159P0C7I6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC159P0C7I6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC159P0C7I6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC159P0C7I6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC159P0C7I6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms