Protein–RNA interactions for Protein: P08134

RHOC, Rho-related GTP-binding protein RhoC, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOCP08134 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHOCP08134 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHOCP08134 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHOCP08134 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHOCP08134 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHOCP08134 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHOCP08134 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RHOCP08134 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RHOCP08134 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHOCP08134 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RHOCP08134 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RHOCP08134 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RHOCP08134 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RHOCP08134 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHOCP08134 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RHOCP08134 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHOCP08134 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHOCP08134 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHOCP08134 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHOCP08134 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHOCP08134 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHOCP08134 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHOCP08134 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHOCP08134 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHOCP08134 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHOCP08134 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHOCP08134 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHOCP08134 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHOCP08134 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHOCP08134 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHOCP08134 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHOCP08134 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHOCP08134 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHOCP08134 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHOCP08134 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHOCP08134 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHOCP08134 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHOCP08134 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHOCP08134 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RHOCP08134 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHOCP08134 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOCP08134 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOCP08134 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOCP08134 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOCP08134 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOCP08134 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOCP08134 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOCP08134 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOCP08134 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOCP08134 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOCP08134 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOCP08134 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOCP08134 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOCP08134 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOCP08134 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOCP08134 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOCP08134 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOCP08134 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOCP08134 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOCP08134 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOCP08134 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOCP08134 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOCP08134 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOCP08134 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOCP08134 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOCP08134 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOCP08134 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOCP08134 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOCP08134 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOCP08134 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOCP08134 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHOCP08134 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHOCP08134 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHOCP08134 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHOCP08134 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHOCP08134 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RHOCP08134 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOCP08134 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOCP08134 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOCP08134 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOCP08134 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOCP08134 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOCP08134 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOCP08134 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOCP08134 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOCP08134 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOCP08134 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOCP08134 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOCP08134 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOCP08134 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOCP08134 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOCP08134 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOCP08134 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOCP08134 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOCP08134 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOCP08134 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOCP08134 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOCP08134 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOCP08134 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOCP08134 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms