Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTSLP07711 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTSLP07711 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTSLP07711 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTSLP07711 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTSLP07711 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTSLP07711 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTSLP07711 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CTSLP07711 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTSLP07711 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTSLP07711 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTSLP07711 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTSLP07711 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTSLP07711 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTSLP07711 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTSLP07711 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTSLP07711 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CTSLP07711 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTSLP07711 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTSLP07711 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSLP07711 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSLP07711 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSLP07711 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSLP07711 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSLP07711 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSLP07711 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSLP07711 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSLP07711 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSLP07711 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSLP07711 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSLP07711 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTSLP07711 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTSLP07711 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTSLP07711 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSLP07711 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSLP07711 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSLP07711 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSLP07711 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSLP07711 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSLP07711 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSLP07711 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSLP07711 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSLP07711 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSLP07711 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSLP07711 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSLP07711 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSLP07711 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSLP07711 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSLP07711 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSLP07711 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSLP07711 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSLP07711 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSLP07711 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSLP07711 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSLP07711 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSLP07711 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSLP07711 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSLP07711 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSLP07711 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSLP07711 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSLP07711 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSLP07711 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSLP07711 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSLP07711 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSLP07711 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSLP07711 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSLP07711 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSLP07711 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTSLP07711 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTSLP07711 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTSLP07711 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSLP07711 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSLP07711 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSLP07711 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSLP07711 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSLP07711 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSLP07711 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSLP07711 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSLP07711 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSLP07711 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSLP07711 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSLP07711 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSLP07711 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSLP07711 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSLP07711 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSLP07711 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSLP07711 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSLP07711 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSLP07711 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSLP07711 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSLP07711 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSLP07711 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSLP07711 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSLP07711 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSLP07711 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSLP07711 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTSLP07711 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTSLP07711 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTSLP07711 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTSLP07711 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms