Protein–RNA interactions for Protein: P07358

C8B, Complement component C8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8BP07358 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8BP07358 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8BP07358 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8BP07358 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8BP07358 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8BP07358 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C8BP07358 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8BP07358 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C8BP07358 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C8BP07358 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C8BP07358 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
C8BP07358 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C8BP07358 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8BP07358 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8BP07358 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8BP07358 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8BP07358 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8BP07358 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8BP07358 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8BP07358 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8BP07358 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8BP07358 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8BP07358 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
C8BP07358 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8BP07358 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8BP07358 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8BP07358 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8BP07358 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8BP07358 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C8BP07358 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C8BP07358 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C8BP07358 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C8BP07358 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C8BP07358 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C8BP07358 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C8BP07358 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C8BP07358 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C8BP07358 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C8BP07358 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C8BP07358 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C8BP07358 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8BP07358 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8BP07358 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8BP07358 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8BP07358 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C8BP07358 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C8BP07358 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C8BP07358 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C8BP07358 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C8BP07358 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C8BP07358 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C8BP07358 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C8BP07358 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C8BP07358 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C8BP07358 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
C8BP07358 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C8BP07358 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C8BP07358 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C8BP07358 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23■■□□□ 1.27
C8BP07358 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C8BP07358 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C8BP07358 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C8BP07358 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C8BP07358 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C8BP07358 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C8BP07358 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C8BP07358 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C8BP07358 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C8BP07358 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C8BP07358 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C8BP07358 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C8BP07358 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C8BP07358 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C8BP07358 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C8BP07358 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C8BP07358 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C8BP07358 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C8BP07358 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C8BP07358 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C8BP07358 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
C8BP07358 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C8BP07358 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C8BP07358 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C8BP07358 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C8BP07358 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C8BP07358 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C8BP07358 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C8BP07358 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
C8BP07358 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C8BP07358 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C8BP07358 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C8BP07358 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C8BP07358 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C8BP07358 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C8BP07358 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C8BP07358 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C8BP07358 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C8BP07358 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C8BP07358 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C8BP07358 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms