Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MBD4O95243 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MBD4O95243 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MBD4O95243 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MBD4O95243 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MBD4O95243 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MBD4O95243 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MBD4O95243 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MBD4O95243 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MBD4O95243 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MBD4O95243 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MBD4O95243 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
MBD4O95243 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MBD4O95243 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MBD4O95243 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
MBD4O95243 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MBD4O95243 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MBD4O95243 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MBD4O95243 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
MBD4O95243 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
MBD4O95243 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MBD4O95243 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MBD4O95243 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MBD4O95243 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MBD4O95243 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MBD4O95243 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MBD4O95243 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MBD4O95243 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MBD4O95243 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MBD4O95243 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MBD4O95243 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MBD4O95243 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MBD4O95243 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MBD4O95243 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MBD4O95243 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MBD4O95243 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MBD4O95243 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MBD4O95243 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MBD4O95243 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MBD4O95243 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MBD4O95243 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
MBD4O95243 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MBD4O95243 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
MBD4O95243 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MBD4O95243 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MBD4O95243 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MBD4O95243 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MBD4O95243 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MBD4O95243 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MBD4O95243 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
MBD4O95243 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MBD4O95243 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MBD4O95243 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MBD4O95243 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MBD4O95243 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MBD4O95243 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MBD4O95243 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MBD4O95243 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MBD4O95243 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MBD4O95243 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MBD4O95243 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MBD4O95243 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
MBD4O95243 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MBD4O95243 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MBD4O95243 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MBD4O95243 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MBD4O95243 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MBD4O95243 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MBD4O95243 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MBD4O95243 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MBD4O95243 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MBD4O95243 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MBD4O95243 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MBD4O95243 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MBD4O95243 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MBD4O95243 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MBD4O95243 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MBD4O95243 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MBD4O95243 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MBD4O95243 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MBD4O95243 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MBD4O95243 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MBD4O95243 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MBD4O95243 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MBD4O95243 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MBD4O95243 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MBD4O95243 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MBD4O95243 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MBD4O95243 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MBD4O95243 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MBD4O95243 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MBD4O95243 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MBD4O95243 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MBD4O95243 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MBD4O95243 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MBD4O95243 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MBD4O95243 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MBD4O95243 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MBD4O95243 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MBD4O95243 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms