Protein–RNA interactions for Protein: O75603

GCM2, Chorion-specific transcription factor GCMb, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM2O75603 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCM2O75603 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCM2O75603 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCM2O75603 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCM2O75603 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCM2O75603 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCM2O75603 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCM2O75603 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCM2O75603 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCM2O75603 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCM2O75603 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCM2O75603 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCM2O75603 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCM2O75603 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCM2O75603 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCM2O75603 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCM2O75603 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCM2O75603 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCM2O75603 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCM2O75603 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCM2O75603 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCM2O75603 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCM2O75603 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GCM2O75603 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCM2O75603 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCM2O75603 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCM2O75603 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCM2O75603 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GCM2O75603 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCM2O75603 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCM2O75603 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCM2O75603 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GCM2O75603 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCM2O75603 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GCM2O75603 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCM2O75603 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCM2O75603 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCM2O75603 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCM2O75603 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCM2O75603 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCM2O75603 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCM2O75603 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCM2O75603 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCM2O75603 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCM2O75603 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCM2O75603 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCM2O75603 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCM2O75603 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCM2O75603 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCM2O75603 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCM2O75603 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCM2O75603 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GCM2O75603 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCM2O75603 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GCM2O75603 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GCM2O75603 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GCM2O75603 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GCM2O75603 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GCM2O75603 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCM2O75603 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCM2O75603 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCM2O75603 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCM2O75603 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCM2O75603 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCM2O75603 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GCM2O75603 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCM2O75603 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCM2O75603 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCM2O75603 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCM2O75603 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCM2O75603 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCM2O75603 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCM2O75603 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCM2O75603 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCM2O75603 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCM2O75603 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCM2O75603 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCM2O75603 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCM2O75603 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCM2O75603 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCM2O75603 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCM2O75603 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCM2O75603 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCM2O75603 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCM2O75603 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCM2O75603 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCM2O75603 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCM2O75603 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCM2O75603 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCM2O75603 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCM2O75603 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCM2O75603 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCM2O75603 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCM2O75603 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCM2O75603 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCM2O75603 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCM2O75603 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GCM2O75603 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GCM2O75603 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCM2O75603 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms