Protein–RNA interactions for Protein: O43463

SUV39H1, Histone-lysine N-methyltransferase SUV39H1, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUV39H1O43463 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUV39H1O43463 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUV39H1O43463 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUV39H1O43463 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SUV39H1O43463 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUV39H1O43463 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SUV39H1O43463 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUV39H1O43463 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUV39H1O43463 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUV39H1O43463 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUV39H1O43463 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SUV39H1O43463 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SUV39H1O43463 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SUV39H1O43463 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUV39H1O43463 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SUV39H1O43463 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUV39H1O43463 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUV39H1O43463 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SUV39H1O43463 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUV39H1O43463 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUV39H1O43463 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUV39H1O43463 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUV39H1O43463 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUV39H1O43463 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUV39H1O43463 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUV39H1O43463 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUV39H1O43463 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUV39H1O43463 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUV39H1O43463 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SUV39H1O43463 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUV39H1O43463 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUV39H1O43463 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUV39H1O43463 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUV39H1O43463 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUV39H1O43463 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUV39H1O43463 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SUV39H1O43463 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUV39H1O43463 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUV39H1O43463 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUV39H1O43463 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUV39H1O43463 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUV39H1O43463 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUV39H1O43463 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUV39H1O43463 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUV39H1O43463 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUV39H1O43463 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUV39H1O43463 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SUV39H1O43463 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUV39H1O43463 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUV39H1O43463 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUV39H1O43463 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SUV39H1O43463 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUV39H1O43463 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUV39H1O43463 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SUV39H1O43463 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUV39H1O43463 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUV39H1O43463 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUV39H1O43463 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUV39H1O43463 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUV39H1O43463 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUV39H1O43463 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUV39H1O43463 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUV39H1O43463 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUV39H1O43463 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUV39H1O43463 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUV39H1O43463 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUV39H1O43463 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUV39H1O43463 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUV39H1O43463 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUV39H1O43463 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUV39H1O43463 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUV39H1O43463 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUV39H1O43463 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUV39H1O43463 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SUV39H1O43463 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUV39H1O43463 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUV39H1O43463 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUV39H1O43463 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SUV39H1O43463 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUV39H1O43463 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUV39H1O43463 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUV39H1O43463 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SUV39H1O43463 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUV39H1O43463 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SUV39H1O43463 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUV39H1O43463 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUV39H1O43463 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUV39H1O43463 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUV39H1O43463 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUV39H1O43463 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUV39H1O43463 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUV39H1O43463 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUV39H1O43463 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUV39H1O43463 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUV39H1O43463 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUV39H1O43463 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUV39H1O43463 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUV39H1O43463 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUV39H1O43463 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUV39H1O43463 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms