Protein–RNA interactions for Protein: O43236

SEPT4, Septin-4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT4O43236 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEPT4O43236 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEPT4O43236 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SEPT4O43236 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEPT4O43236 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEPT4O43236 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEPT4O43236 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEPT4O43236 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEPT4O43236 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEPT4O43236 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEPT4O43236 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEPT4O43236 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEPT4O43236 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SEPT4O43236 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEPT4O43236 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEPT4O43236 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEPT4O43236 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEPT4O43236 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEPT4O43236 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SEPT4O43236 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEPT4O43236 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEPT4O43236 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEPT4O43236 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEPT4O43236 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEPT4O43236 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SEPT4O43236 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SEPT4O43236 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SEPT4O43236 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SEPT4O43236 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SEPT4O43236 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SEPT4O43236 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SEPT4O43236 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SEPT4O43236 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SEPT4O43236 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SEPT4O43236 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEPT4O43236 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SEPT4O43236 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SEPT4O43236 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEPT4O43236 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SEPT4O43236 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEPT4O43236 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SEPT4O43236 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SEPT4O43236 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SEPT4O43236 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SEPT4O43236 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SEPT4O43236 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SEPT4O43236 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
SEPT4O43236 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SEPT4O43236 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SEPT4O43236 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SEPT4O43236 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEPT4O43236 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEPT4O43236 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEPT4O43236 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEPT4O43236 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEPT4O43236 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEPT4O43236 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEPT4O43236 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEPT4O43236 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEPT4O43236 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEPT4O43236 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEPT4O43236 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEPT4O43236 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEPT4O43236 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SEPT4O43236 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEPT4O43236 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEPT4O43236 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SEPT4O43236 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEPT4O43236 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEPT4O43236 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEPT4O43236 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEPT4O43236 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEPT4O43236 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEPT4O43236 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEPT4O43236 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SEPT4O43236 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SEPT4O43236 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SEPT4O43236 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SEPT4O43236 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEPT4O43236 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEPT4O43236 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEPT4O43236 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEPT4O43236 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SEPT4O43236 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEPT4O43236 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEPT4O43236 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEPT4O43236 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEPT4O43236 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEPT4O43236 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEPT4O43236 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEPT4O43236 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEPT4O43236 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEPT4O43236 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEPT4O43236 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SEPT4O43236 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SEPT4O43236 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEPT4O43236 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SEPT4O43236 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEPT4O43236 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEPT4O43236 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms