Protein–RNA interactions for Protein: O14983

ATP2A1, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A1O14983 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP2A1O14983 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP2A1O14983 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP2A1O14983 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP2A1O14983 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP2A1O14983 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP2A1O14983 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP2A1O14983 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP2A1O14983 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP2A1O14983 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP2A1O14983 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP2A1O14983 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP2A1O14983 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP2A1O14983 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP2A1O14983 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP2A1O14983 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP2A1O14983 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2A1O14983 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2A1O14983 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2A1O14983 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2A1O14983 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2A1O14983 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2A1O14983 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2A1O14983 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2A1O14983 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2A1O14983 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2A1O14983 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2A1O14983 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP2A1O14983 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP2A1O14983 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP2A1O14983 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP2A1O14983 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP2A1O14983 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP2A1O14983 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP2A1O14983 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP2A1O14983 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP2A1O14983 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP2A1O14983 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP2A1O14983 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP2A1O14983 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP2A1O14983 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP2A1O14983 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP2A1O14983 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ATP2A1O14983 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP2A1O14983 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP2A1O14983 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP2A1O14983 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP2A1O14983 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP2A1O14983 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP2A1O14983 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2A1O14983 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2A1O14983 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2A1O14983 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2A1O14983 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2A1O14983 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP2A1O14983 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP2A1O14983 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP2A1O14983 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP2A1O14983 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP2A1O14983 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP2A1O14983 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP2A1O14983 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP2A1O14983 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP2A1O14983 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP2A1O14983 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP2A1O14983 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP2A1O14983 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP2A1O14983 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2A1O14983 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2A1O14983 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2A1O14983 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2A1O14983 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2A1O14983 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2A1O14983 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2A1O14983 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2A1O14983 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2A1O14983 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
ATP2A1O14983 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP2A1O14983 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP2A1O14983 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP2A1O14983 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2A1O14983 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2A1O14983 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2A1O14983 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2A1O14983 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2A1O14983 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP2A1O14983 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP2A1O14983 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP2A1O14983 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP2A1O14983 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2A1O14983 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2A1O14983 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2A1O14983 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2A1O14983 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2A1O14983 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP2A1O14983 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP2A1O14983 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP2A1O14983 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP2A1O14983 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP2A1O14983 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms