Protein–RNA interactions for Protein: O00567

NOP56, Nucleolar protein 56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56O00567 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NOP56O00567 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NOP56O00567 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NOP56O00567 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NOP56O00567 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NOP56O00567 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NOP56O00567 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NOP56O00567 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NOP56O00567 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NOP56O00567 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NOP56O00567 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NOP56O00567 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NOP56O00567 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NOP56O00567 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NOP56O00567 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NOP56O00567 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NOP56O00567 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NOP56O00567 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOP56O00567 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOP56O00567 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOP56O00567 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOP56O00567 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOP56O00567 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOP56O00567 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NOP56O00567 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NOP56O00567 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NOP56O00567 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NOP56O00567 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NOP56O00567 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NOP56O00567 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NOP56O00567 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NOP56O00567 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NOP56O00567 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NOP56O00567 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NOP56O00567 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NOP56O00567 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NOP56O00567 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NOP56O00567 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NOP56O00567 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NOP56O00567 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NOP56O00567 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NOP56O00567 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NOP56O00567 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NOP56O00567 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NOP56O00567 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NOP56O00567 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NOP56O00567 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NOP56O00567 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NOP56O00567 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NOP56O00567 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NOP56O00567 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NOP56O00567 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NOP56O00567 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NOP56O00567 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NOP56O00567 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NOP56O00567 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NOP56O00567 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NOP56O00567 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NOP56O00567 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NOP56O00567 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NOP56O00567 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NOP56O00567 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NOP56O00567 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NOP56O00567 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NOP56O00567 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NOP56O00567 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NOP56O00567 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NOP56O00567 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NOP56O00567 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NOP56O00567 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NOP56O00567 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NOP56O00567 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NOP56O00567 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NOP56O00567 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NOP56O00567 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOP56O00567 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOP56O00567 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOP56O00567 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOP56O00567 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOP56O00567 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOP56O00567 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOP56O00567 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NOP56O00567 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NOP56O00567 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NOP56O00567 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NOP56O00567 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NOP56O00567 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NOP56O00567 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NOP56O00567 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NOP56O00567 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NOP56O00567 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NOP56O00567 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NOP56O00567 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NOP56O00567 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NOP56O00567 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NOP56O00567 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NOP56O00567 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NOP56O00567 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NOP56O00567 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NOP56O00567 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms