Protein–RNA interactions for Protein: B5ME19

EIF3CL, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CLB5ME19 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF3CLB5ME19 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF3CLB5ME19 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF3CLB5ME19 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF3CLB5ME19 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF3CLB5ME19 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF3CLB5ME19 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF3CLB5ME19 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EIF3CLB5ME19 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EIF3CLB5ME19 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EIF3CLB5ME19 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EIF3CLB5ME19 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EIF3CLB5ME19 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EIF3CLB5ME19 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EIF3CLB5ME19 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
EIF3CLB5ME19 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
EIF3CLB5ME19 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
EIF3CLB5ME19 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EIF3CLB5ME19 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EIF3CLB5ME19 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EIF3CLB5ME19 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EIF3CLB5ME19 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EIF3CLB5ME19 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EIF3CLB5ME19 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EIF3CLB5ME19 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EIF3CLB5ME19 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EIF3CLB5ME19 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EIF3CLB5ME19 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EIF3CLB5ME19 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EIF3CLB5ME19 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EIF3CLB5ME19 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EIF3CLB5ME19 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EIF3CLB5ME19 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF3CLB5ME19 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF3CLB5ME19 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF3CLB5ME19 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF3CLB5ME19 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF3CLB5ME19 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF3CLB5ME19 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EIF3CLB5ME19 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EIF3CLB5ME19 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EIF3CLB5ME19 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EIF3CLB5ME19 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EIF3CLB5ME19 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EIF3CLB5ME19 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EIF3CLB5ME19 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EIF3CLB5ME19 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EIF3CLB5ME19 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EIF3CLB5ME19 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EIF3CLB5ME19 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EIF3CLB5ME19 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EIF3CLB5ME19 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EIF3CLB5ME19 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EIF3CLB5ME19 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EIF3CLB5ME19 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EIF3CLB5ME19 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EIF3CLB5ME19 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EIF3CLB5ME19 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
EIF3CLB5ME19 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EIF3CLB5ME19 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EIF3CLB5ME19 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EIF3CLB5ME19 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EIF3CLB5ME19 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EIF3CLB5ME19 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EIF3CLB5ME19 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EIF3CLB5ME19 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EIF3CLB5ME19 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EIF3CLB5ME19 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EIF3CLB5ME19 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EIF3CLB5ME19 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EIF3CLB5ME19 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EIF3CLB5ME19 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EIF3CLB5ME19 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EIF3CLB5ME19 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EIF3CLB5ME19 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EIF3CLB5ME19 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EIF3CLB5ME19 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EIF3CLB5ME19 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EIF3CLB5ME19 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EIF3CLB5ME19 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EIF3CLB5ME19 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EIF3CLB5ME19 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EIF3CLB5ME19 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EIF3CLB5ME19 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EIF3CLB5ME19 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF3CLB5ME19 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF3CLB5ME19 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF3CLB5ME19 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF3CLB5ME19 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF3CLB5ME19 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EIF3CLB5ME19 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EIF3CLB5ME19 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EIF3CLB5ME19 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EIF3CLB5ME19 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EIF3CLB5ME19 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EIF3CLB5ME19 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EIF3CLB5ME19 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EIF3CLB5ME19 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EIF3CLB5ME19 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EIF3CLB5ME19 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms