Protein–RNA interactions for Protein: A8MUH7

PDZK1P1, Putative PDZ domain-containing protein PDZK1P1, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1P1A8MUH7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDZK1P1A8MUH7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PDZK1P1A8MUH7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms