Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPRYD3Q8NCJ5 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122 ms