Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCSO14618 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCSO14618 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCSO14618 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCSO14618 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCSO14618 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCSO14618 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCSO14618 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCSO14618 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCSO14618 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCSO14618 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCSO14618 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCSO14618 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCSO14618 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCSO14618 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCSO14618 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCSO14618 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCSO14618 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CCSO14618 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCSO14618 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCSO14618 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCSO14618 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCSO14618 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CCSO14618 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCSO14618 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCSO14618 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCSO14618 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCSO14618 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CCSO14618 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCSO14618 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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