Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms