RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437322.2

USP27X-AS1-201, Transcript of USP27X antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP27X-AS1, Length 2,175 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.19■■■■□ 3.7
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.33■■■□□ 2.93
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ABCC9O60706 1549 aa31.59■■■□□ 2.65
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.58■■■□□ 2.65
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.55■■■□□ 2.64
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.18■■■□□ 2.58
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.16■■■□□ 2.58
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NACADO15069 1562 aa31.04■■■□□ 2.56
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.8■■■□□ 2.52
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SCRIBQ14160 1630 aa30.68■■■□□ 2.5
USP27X-AS1-201ENST00000437322 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.23■■■□□ 2.43
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.89■■■□□ 2.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.77■■■□□ 2.36
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.7■■■□□ 2.34
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.52■■■□□ 2.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SMARCA4P51532 1647 aa29.39■■■□□ 2.29
USP27X-AS1-201ENST00000437322 WIZO95785 1651 aa29.3■■■□□ 2.28
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PEG3Q9GZU2 1588 aa29■■■□□ 2.23
USP27X-AS1-201ENST00000437322 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.89■■■□□ 2.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SMARCA2P51531 1590 aa28.88■■■□□ 2.21
USP27X-AS1-201ENST00000437322 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.67■■■□□ 2.18
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NCAPD3P42695 1498 aa28.63■■■□□ 2.17
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.61■■■□□ 2.17
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HMGXB3Q12766 1538 aa28.61■■■□□ 2.17
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.58■■■□□ 2.17
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HRCP23327 699 aa28.35■■■□□ 2.13
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.17■■■□□ 2.1
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRIM41Q8WV44 630 aa28.14■■■□□ 2.09
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ABCC8Q09428 1581 aa28.08■■■□□ 2.09
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CFTRP13569 1480 aa28■■■□□ 2.07
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.91■■■□□ 2.06
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PRDM2Q13029 1718 aa27.9■■■□□ 2.06
USP27X-AS1-201ENST00000437322 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.87■■■□□ 2.05
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.84■■■□□ 2.05
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SYNJ1O43426 1573 aa27.79■■■□□ 2.04
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NESP48681 1621 aa27.73■■■□□ 2.03
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.69■■■□□ 2.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TOP2BQ02880 1626 aa27.66■■■□□ 2.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.64■■■□□ 2.01
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.62■■■□□ 2.01
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CUX1P39880 1505 aa27.61■■■□□ 2.01
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.53■■■□□ 2
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SOGA1O94964 1423 aa27.53■■■□□ 2
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.46■■□□□ 1.99
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.45■■□□□ 1.99
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.44■■□□□ 1.98
USP27X-AS1-201ENST00000437322 EEA1Q15075 1411 aa27.42■■□□□ 1.98
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.41■■□□□ 1.98
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.37■■□□□ 1.97
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TOPBP1Q92547 1522 aa27.32■■□□□ 1.96
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.31■■□□□ 1.96
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
USP27X-AS1-201ENST00000437322 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.29■■□□□ 1.96
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.29■■□□□ 1.96
USP27X-AS1-201ENST00000437322 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
USP27X-AS1-201ENST00000437322 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KIF27Q86VH2 1401 aa27.16■■□□□ 1.94
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.13■■□□□ 1.93
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CUX2O14529 1486 aa27.12■■□□□ 1.93
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.1■■□□□ 1.93
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KIF21BO75037 1637 aa27.1■■□□□ 1.93
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ERCC6Q03468 1493 aa27.08■■□□□ 1.93
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GOLGA3Q08378 1498 aa27.07■■□□□ 1.92
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.05■■□□□ 1.92
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
USP27X-AS1-201ENST00000437322 WDR97A6NE52 1622 aa27■■□□□ 1.91
USP27X-AS1-201ENST00000437322 WDR62O43379 1518 aa27■■□□□ 1.91
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PRXQ9BXM0 1461 aa26.97■■□□□ 1.91
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.97■■□□□ 1.91
USP27X-AS1-201ENST00000437322 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.95■■□□□ 1.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IGF1RP08069 1367 aa26.92■■□□□ 1.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.92■■□□□ 1.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.86■■□□□ 1.89
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CEP162Q5TB80 1403 aa26.84■■□□□ 1.89
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.79■■□□□ 1.88
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.79■■□□□ 1.88
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IFT140Q96RY7 1462 aa26.78■■□□□ 1.88
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CUL7Q14999 1698 aa26.75■■□□□ 1.87
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PBRM1Q86U86 1689 aa26.68■■□□□ 1.86
USP27X-AS1-201ENST00000437322 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.68■■□□□ 1.86
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CLIP1P30622 1438 aa26.64■■□□□ 1.86
USP27X-AS1-201ENST00000437322 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GRIN2BQ13224 1484 aa26.58■■□□□ 1.85
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ADAMTS12P58397 1594 aa26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 1142.8 ms