Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUR7

ANKRD20A3, Ankyrin repeat domain-containing protein 20A3, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD20A3Q5VUR7 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ANKRD20A3Q5VUR7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ANKRD20A3Q5VUR7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ANKRD20A3Q5VUR7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD20A3Q5VUR7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD20A3Q5VUR7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD20A3Q5VUR7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD20A3Q5VUR7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD20A3Q5VUR7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD20A3Q5VUR7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD20A3Q5VUR7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD20A3Q5VUR7 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD20A3Q5VUR7 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD20A3Q5VUR7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD20A3Q5VUR7 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD20A3Q5VUR7 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD20A3Q5VUR7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD20A3Q5VUR7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD20A3Q5VUR7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms