Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms