Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HCN4Q9Y3Q4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HCN4Q9Y3Q4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HCN4Q9Y3Q4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HCN4Q9Y3Q4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HCN4Q9Y3Q4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HCN4Q9Y3Q4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HCN4Q9Y3Q4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HCN4Q9Y3Q4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HCN4Q9Y3Q4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HCN4Q9Y3Q4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HCN4Q9Y3Q4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HCN4Q9Y3Q4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HCN4Q9Y3Q4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HCN4Q9Y3Q4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HCN4Q9Y3Q4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HCN4Q9Y3Q4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HCN4Q9Y3Q4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HCN4Q9Y3Q4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HCN4Q9Y3Q4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HCN4Q9Y3Q4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HCN4Q9Y3Q4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HCN4Q9Y3Q4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HCN4Q9Y3Q4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HCN4Q9Y3Q4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HCN4Q9Y3Q4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HCN4Q9Y3Q4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HCN4Q9Y3Q4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HCN4Q9Y3Q4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HCN4Q9Y3Q4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HCN4Q9Y3Q4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HCN4Q9Y3Q4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HCN4Q9Y3Q4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HCN4Q9Y3Q4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HCN4Q9Y3Q4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HCN4Q9Y3Q4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HCN4Q9Y3Q4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HCN4Q9Y3Q4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HCN4Q9Y3Q4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HCN4Q9Y3Q4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HCN4Q9Y3Q4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HCN4Q9Y3Q4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HCN4Q9Y3Q4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HCN4Q9Y3Q4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
HCN4Q9Y3Q4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HCN4Q9Y3Q4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HCN4Q9Y3Q4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HCN4Q9Y3Q4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HCN4Q9Y3Q4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HCN4Q9Y3Q4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HCN4Q9Y3Q4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HCN4Q9Y3Q4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HCN4Q9Y3Q4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HCN4Q9Y3Q4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HCN4Q9Y3Q4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HCN4Q9Y3Q4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HCN4Q9Y3Q4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HCN4Q9Y3Q4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HCN4Q9Y3Q4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HCN4Q9Y3Q4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HCN4Q9Y3Q4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HCN4Q9Y3Q4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HCN4Q9Y3Q4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HCN4Q9Y3Q4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HCN4Q9Y3Q4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HCN4Q9Y3Q4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HCN4Q9Y3Q4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HCN4Q9Y3Q4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HCN4Q9Y3Q4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HCN4Q9Y3Q4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HCN4Q9Y3Q4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HCN4Q9Y3Q4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HCN4Q9Y3Q4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HCN4Q9Y3Q4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HCN4Q9Y3Q4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HCN4Q9Y3Q4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HCN4Q9Y3Q4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HCN4Q9Y3Q4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HCN4Q9Y3Q4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HCN4Q9Y3Q4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HCN4Q9Y3Q4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HCN4Q9Y3Q4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HCN4Q9Y3Q4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HCN4Q9Y3Q4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HCN4Q9Y3Q4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HCN4Q9Y3Q4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HCN4Q9Y3Q4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HCN4Q9Y3Q4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HCN4Q9Y3Q4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HCN4Q9Y3Q4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HCN4Q9Y3Q4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HCN4Q9Y3Q4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HCN4Q9Y3Q4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HCN4Q9Y3Q4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HCN4Q9Y3Q4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HCN4Q9Y3Q4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HCN4Q9Y3Q4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HCN4Q9Y3Q4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HCN4Q9Y3Q4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HCN4Q9Y3Q4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
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