Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP20Q9Y2K6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP20Q9Y2K6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP20Q9Y2K6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP20Q9Y2K6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP20Q9Y2K6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP20Q9Y2K6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP20Q9Y2K6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP20Q9Y2K6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
USP20Q9Y2K6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP20Q9Y2K6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP20Q9Y2K6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP20Q9Y2K6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP20Q9Y2K6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP20Q9Y2K6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
USP20Q9Y2K6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP20Q9Y2K6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP20Q9Y2K6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP20Q9Y2K6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP20Q9Y2K6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP20Q9Y2K6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP20Q9Y2K6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP20Q9Y2K6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP20Q9Y2K6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP20Q9Y2K6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP20Q9Y2K6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP20Q9Y2K6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP20Q9Y2K6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP20Q9Y2K6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27■■□□□ 1.91
USP20Q9Y2K6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USP20Q9Y2K6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP20Q9Y2K6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP20Q9Y2K6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP20Q9Y2K6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP20Q9Y2K6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP20Q9Y2K6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP20Q9Y2K6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP20Q9Y2K6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP20Q9Y2K6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP20Q9Y2K6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP20Q9Y2K6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP20Q9Y2K6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP20Q9Y2K6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP20Q9Y2K6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP20Q9Y2K6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP20Q9Y2K6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP20Q9Y2K6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP20Q9Y2K6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP20Q9Y2K6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP20Q9Y2K6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP20Q9Y2K6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP20Q9Y2K6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP20Q9Y2K6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP20Q9Y2K6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
USP20Q9Y2K6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP20Q9Y2K6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms