Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PADI1Q9ULC6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PADI1Q9ULC6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PADI1Q9ULC6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PADI1Q9ULC6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PADI1Q9ULC6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PADI1Q9ULC6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PADI1Q9ULC6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PADI1Q9ULC6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PADI1Q9ULC6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PADI1Q9ULC6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PADI1Q9ULC6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PADI1Q9ULC6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PADI1Q9ULC6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PADI1Q9ULC6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PADI1Q9ULC6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PADI1Q9ULC6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PADI1Q9ULC6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PADI1Q9ULC6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PADI1Q9ULC6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PADI1Q9ULC6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PADI1Q9ULC6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PADI1Q9ULC6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PADI1Q9ULC6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PADI1Q9ULC6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PADI1Q9ULC6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PADI1Q9ULC6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PADI1Q9ULC6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PADI1Q9ULC6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PADI1Q9ULC6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PADI1Q9ULC6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PADI1Q9ULC6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PADI1Q9ULC6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PADI1Q9ULC6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PADI1Q9ULC6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PADI1Q9ULC6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PADI1Q9ULC6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PADI1Q9ULC6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PADI1Q9ULC6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PADI1Q9ULC6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PADI1Q9ULC6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PADI1Q9ULC6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PADI1Q9ULC6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PADI1Q9ULC6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PADI1Q9ULC6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PADI1Q9ULC6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PADI1Q9ULC6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PADI1Q9ULC6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PADI1Q9ULC6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PADI1Q9ULC6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PADI1Q9ULC6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PADI1Q9ULC6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PADI1Q9ULC6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PADI1Q9ULC6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PADI1Q9ULC6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PADI1Q9ULC6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PADI1Q9ULC6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PADI1Q9ULC6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PADI1Q9ULC6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PADI1Q9ULC6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PADI1Q9ULC6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PADI1Q9ULC6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PADI1Q9ULC6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PADI1Q9ULC6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PADI1Q9ULC6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PADI1Q9ULC6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PADI1Q9ULC6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PADI1Q9ULC6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PADI1Q9ULC6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PADI1Q9ULC6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PADI1Q9ULC6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PADI1Q9ULC6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PADI1Q9ULC6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PADI1Q9ULC6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PADI1Q9ULC6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PADI1Q9ULC6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PADI1Q9ULC6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PADI1Q9ULC6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PADI1Q9ULC6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PADI1Q9ULC6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PADI1Q9ULC6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PADI1Q9ULC6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PADI1Q9ULC6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PADI1Q9ULC6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PADI1Q9ULC6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PADI1Q9ULC6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PADI1Q9ULC6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PADI1Q9ULC6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PADI1Q9ULC6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PADI1Q9ULC6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PADI1Q9ULC6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PADI1Q9ULC6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PADI1Q9ULC6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PADI1Q9ULC6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PADI1Q9ULC6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PADI1Q9ULC6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PADI1Q9ULC6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PADI1Q9ULC6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PADI1Q9ULC6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PADI1Q9ULC6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms