Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII4

HERC5, E3 ISG15--protein ligase HERC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5Q9UII4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HERC5Q9UII4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HERC5Q9UII4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HERC5Q9UII4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HERC5Q9UII4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
HERC5Q9UII4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HERC5Q9UII4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HERC5Q9UII4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HERC5Q9UII4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HERC5Q9UII4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
HERC5Q9UII4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HERC5Q9UII4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HERC5Q9UII4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HERC5Q9UII4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HERC5Q9UII4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HERC5Q9UII4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HERC5Q9UII4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HERC5Q9UII4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HERC5Q9UII4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HERC5Q9UII4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HERC5Q9UII4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HERC5Q9UII4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HERC5Q9UII4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HERC5Q9UII4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HERC5Q9UII4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HERC5Q9UII4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HERC5Q9UII4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HERC5Q9UII4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HERC5Q9UII4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
HERC5Q9UII4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
HERC5Q9UII4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HERC5Q9UII4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
HERC5Q9UII4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HERC5Q9UII4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HERC5Q9UII4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HERC5Q9UII4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HERC5Q9UII4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HERC5Q9UII4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HERC5Q9UII4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HERC5Q9UII4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HERC5Q9UII4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HERC5Q9UII4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
HERC5Q9UII4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HERC5Q9UII4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HERC5Q9UII4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HERC5Q9UII4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HERC5Q9UII4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
HERC5Q9UII4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HERC5Q9UII4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HERC5Q9UII4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HERC5Q9UII4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HERC5Q9UII4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HERC5Q9UII4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HERC5Q9UII4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HERC5Q9UII4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HERC5Q9UII4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HERC5Q9UII4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
HERC5Q9UII4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HERC5Q9UII4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HERC5Q9UII4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HERC5Q9UII4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HERC5Q9UII4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HERC5Q9UII4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HERC5Q9UII4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HERC5Q9UII4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HERC5Q9UII4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HERC5Q9UII4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HERC5Q9UII4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HERC5Q9UII4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HERC5Q9UII4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
HERC5Q9UII4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HERC5Q9UII4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HERC5Q9UII4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HERC5Q9UII4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HERC5Q9UII4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HERC5Q9UII4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HERC5Q9UII4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HERC5Q9UII4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HERC5Q9UII4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HERC5Q9UII4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HERC5Q9UII4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HERC5Q9UII4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HERC5Q9UII4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HERC5Q9UII4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HERC5Q9UII4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HERC5Q9UII4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HERC5Q9UII4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HERC5Q9UII4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
HERC5Q9UII4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
HERC5Q9UII4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HERC5Q9UII4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
HERC5Q9UII4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HERC5Q9UII4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HERC5Q9UII4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
HERC5Q9UII4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HERC5Q9UII4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
HERC5Q9UII4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HERC5Q9UII4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HERC5Q9UII4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HERC5Q9UII4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms