Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCF20Q9UGU0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCF20Q9UGU0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCF20Q9UGU0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TCF20Q9UGU0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCF20Q9UGU0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCF20Q9UGU0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCF20Q9UGU0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCF20Q9UGU0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TCF20Q9UGU0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCF20Q9UGU0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCF20Q9UGU0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCF20Q9UGU0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCF20Q9UGU0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCF20Q9UGU0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TCF20Q9UGU0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCF20Q9UGU0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCF20Q9UGU0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCF20Q9UGU0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCF20Q9UGU0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCF20Q9UGU0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCF20Q9UGU0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TCF20Q9UGU0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCF20Q9UGU0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TCF20Q9UGU0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCF20Q9UGU0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TCF20Q9UGU0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCF20Q9UGU0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TCF20Q9UGU0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCF20Q9UGU0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCF20Q9UGU0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCF20Q9UGU0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCF20Q9UGU0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCF20Q9UGU0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCF20Q9UGU0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCF20Q9UGU0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCF20Q9UGU0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCF20Q9UGU0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCF20Q9UGU0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TCF20Q9UGU0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TCF20Q9UGU0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TCF20Q9UGU0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TCF20Q9UGU0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TCF20Q9UGU0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TCF20Q9UGU0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TCF20Q9UGU0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
TCF20Q9UGU0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
TCF20Q9UGU0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
TCF20Q9UGU0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TCF20Q9UGU0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TCF20Q9UGU0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TCF20Q9UGU0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TCF20Q9UGU0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TCF20Q9UGU0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
TCF20Q9UGU0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TCF20Q9UGU0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TCF20Q9UGU0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TCF20Q9UGU0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCF20Q9UGU0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TCF20Q9UGU0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCF20Q9UGU0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCF20Q9UGU0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCF20Q9UGU0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCF20Q9UGU0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCF20Q9UGU0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCF20Q9UGU0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCF20Q9UGU0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCF20Q9UGU0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TCF20Q9UGU0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCF20Q9UGU0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCF20Q9UGU0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCF20Q9UGU0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCF20Q9UGU0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TCF20Q9UGU0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TCF20Q9UGU0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TCF20Q9UGU0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TCF20Q9UGU0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TCF20Q9UGU0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
TCF20Q9UGU0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
TCF20Q9UGU0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TCF20Q9UGU0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TCF20Q9UGU0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TCF20Q9UGU0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TCF20Q9UGU0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCF20Q9UGU0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCF20Q9UGU0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCF20Q9UGU0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCF20Q9UGU0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCF20Q9UGU0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCF20Q9UGU0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCF20Q9UGU0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCF20Q9UGU0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCF20Q9UGU0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCF20Q9UGU0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCF20Q9UGU0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCF20Q9UGU0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCF20Q9UGU0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCF20Q9UGU0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCF20Q9UGU0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCF20Q9UGU0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms