Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGT4

SUSD2, Sushi domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD2Q9UGT4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUSD2Q9UGT4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUSD2Q9UGT4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SUSD2Q9UGT4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SUSD2Q9UGT4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SUSD2Q9UGT4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SUSD2Q9UGT4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SUSD2Q9UGT4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SUSD2Q9UGT4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUSD2Q9UGT4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SUSD2Q9UGT4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUSD2Q9UGT4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD2Q9UGT4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD2Q9UGT4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD2Q9UGT4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD2Q9UGT4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD2Q9UGT4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD2Q9UGT4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD2Q9UGT4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUSD2Q9UGT4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUSD2Q9UGT4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUSD2Q9UGT4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUSD2Q9UGT4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SUSD2Q9UGT4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUSD2Q9UGT4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUSD2Q9UGT4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUSD2Q9UGT4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD2Q9UGT4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD2Q9UGT4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD2Q9UGT4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUSD2Q9UGT4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUSD2Q9UGT4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUSD2Q9UGT4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUSD2Q9UGT4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUSD2Q9UGT4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUSD2Q9UGT4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUSD2Q9UGT4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUSD2Q9UGT4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUSD2Q9UGT4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUSD2Q9UGT4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUSD2Q9UGT4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SUSD2Q9UGT4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUSD2Q9UGT4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUSD2Q9UGT4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUSD2Q9UGT4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUSD2Q9UGT4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUSD2Q9UGT4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUSD2Q9UGT4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUSD2Q9UGT4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUSD2Q9UGT4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUSD2Q9UGT4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SUSD2Q9UGT4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUSD2Q9UGT4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUSD2Q9UGT4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SUSD2Q9UGT4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUSD2Q9UGT4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUSD2Q9UGT4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUSD2Q9UGT4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUSD2Q9UGT4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUSD2Q9UGT4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUSD2Q9UGT4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUSD2Q9UGT4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD2Q9UGT4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD2Q9UGT4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD2Q9UGT4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD2Q9UGT4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD2Q9UGT4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD2Q9UGT4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD2Q9UGT4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SUSD2Q9UGT4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUSD2Q9UGT4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUSD2Q9UGT4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUSD2Q9UGT4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUSD2Q9UGT4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SUSD2Q9UGT4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUSD2Q9UGT4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUSD2Q9UGT4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUSD2Q9UGT4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUSD2Q9UGT4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUSD2Q9UGT4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUSD2Q9UGT4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUSD2Q9UGT4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUSD2Q9UGT4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUSD2Q9UGT4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SUSD2Q9UGT4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUSD2Q9UGT4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUSD2Q9UGT4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUSD2Q9UGT4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUSD2Q9UGT4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUSD2Q9UGT4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUSD2Q9UGT4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUSD2Q9UGT4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUSD2Q9UGT4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUSD2Q9UGT4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUSD2Q9UGT4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUSD2Q9UGT4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUSD2Q9UGT4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SUSD2Q9UGT4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUSD2Q9UGT4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUSD2Q9UGT4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.9 ms