Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
DNMT3BQ9UBC3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNMT3BQ9UBC3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNMT3BQ9UBC3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNMT3BQ9UBC3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
DNMT3BQ9UBC3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNMT3BQ9UBC3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
DNMT3BQ9UBC3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNMT3BQ9UBC3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNMT3BQ9UBC3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNMT3BQ9UBC3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNMT3BQ9UBC3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNMT3BQ9UBC3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNMT3BQ9UBC3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNMT3BQ9UBC3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNMT3BQ9UBC3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNMT3BQ9UBC3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNMT3BQ9UBC3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNMT3BQ9UBC3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNMT3BQ9UBC3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNMT3BQ9UBC3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
DNMT3BQ9UBC3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNMT3BQ9UBC3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNMT3BQ9UBC3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNMT3BQ9UBC3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNMT3BQ9UBC3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
DNMT3BQ9UBC3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNMT3BQ9UBC3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
DNMT3BQ9UBC3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNMT3BQ9UBC3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNMT3BQ9UBC3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNMT3BQ9UBC3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNMT3BQ9UBC3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNMT3BQ9UBC3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNMT3BQ9UBC3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNMT3BQ9UBC3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNMT3BQ9UBC3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNMT3BQ9UBC3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNMT3BQ9UBC3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNMT3BQ9UBC3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DNMT3BQ9UBC3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNMT3BQ9UBC3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNMT3BQ9UBC3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNMT3BQ9UBC3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
DNMT3BQ9UBC3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNMT3BQ9UBC3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNMT3BQ9UBC3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNMT3BQ9UBC3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNMT3BQ9UBC3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNMT3BQ9UBC3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNMT3BQ9UBC3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNMT3BQ9UBC3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNMT3BQ9UBC3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DNMT3BQ9UBC3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNMT3BQ9UBC3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNMT3BQ9UBC3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNMT3BQ9UBC3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNMT3BQ9UBC3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNMT3BQ9UBC3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNMT3BQ9UBC3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNMT3BQ9UBC3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNMT3BQ9UBC3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNMT3BQ9UBC3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNMT3BQ9UBC3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNMT3BQ9UBC3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNMT3BQ9UBC3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNMT3BQ9UBC3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNMT3BQ9UBC3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNMT3BQ9UBC3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNMT3BQ9UBC3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNMT3BQ9UBC3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNMT3BQ9UBC3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNMT3BQ9UBC3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNMT3BQ9UBC3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNMT3BQ9UBC3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNMT3BQ9UBC3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNMT3BQ9UBC3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNMT3BQ9UBC3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNMT3BQ9UBC3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNMT3BQ9UBC3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNMT3BQ9UBC3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DNMT3BQ9UBC3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNMT3BQ9UBC3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNMT3BQ9UBC3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNMT3BQ9UBC3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNMT3BQ9UBC3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNMT3BQ9UBC3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNMT3BQ9UBC3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNMT3BQ9UBC3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNMT3BQ9UBC3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNMT3BQ9UBC3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNMT3BQ9UBC3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNMT3BQ9UBC3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
DNMT3BQ9UBC3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNMT3BQ9UBC3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNMT3BQ9UBC3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNMT3BQ9UBC3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
DNMT3BQ9UBC3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNMT3BQ9UBC3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNMT3BQ9UBC3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms