Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
CC2D2AQ9P2K1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
CC2D2AQ9P2K1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
CC2D2AQ9P2K1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
CC2D2AQ9P2K1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
CC2D2AQ9P2K1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.63■■■■■ 4.9
CC2D2AQ9P2K1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC45.63■■■■■ 4.89
CC2D2AQ9P2K1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC45.63■■■■■ 4.89
CC2D2AQ9P2K1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.89
CC2D2AQ9P2K1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
CC2D2AQ9P2K1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC45.61■■■■■ 4.89
CC2D2AQ9P2K1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC45.61■■■■■ 4.89
CC2D2AQ9P2K1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
CC2D2AQ9P2K1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
CC2D2AQ9P2K1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC45.59■■■■■ 4.89
CC2D2AQ9P2K1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC45.59■■■■■ 4.89
CC2D2AQ9P2K1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.58■■■■■ 4.89
CC2D2AQ9P2K1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
CC2D2AQ9P2K1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC45.58■■■■■ 4.89
CC2D2AQ9P2K1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC45.57■■■■■ 4.89
CC2D2AQ9P2K1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.89
CC2D2AQ9P2K1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC45.55■■■■■ 4.88
CC2D2AQ9P2K1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.55■■■■■ 4.88
CC2D2AQ9P2K1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
CC2D2AQ9P2K1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
CC2D2AQ9P2K1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
CC2D2AQ9P2K1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.55■■■■■ 4.88
CC2D2AQ9P2K1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
CC2D2AQ9P2K1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
CC2D2AQ9P2K1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.54■■■■■ 4.88
CC2D2AQ9P2K1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.54■■■■■ 4.88
CC2D2AQ9P2K1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC45.54■■■■■ 4.88
CC2D2AQ9P2K1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
CC2D2AQ9P2K1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC45.53■■■■■ 4.88
CC2D2AQ9P2K1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
CC2D2AQ9P2K1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC45.52■■■■■ 4.88
CC2D2AQ9P2K1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC45.52■■■■■ 4.88
CC2D2AQ9P2K1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC45.52■■■■■ 4.88
CC2D2AQ9P2K1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
CC2D2AQ9P2K1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
CC2D2AQ9P2K1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC45.51■■■■■ 4.88
CC2D2AQ9P2K1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
CC2D2AQ9P2K1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC45.47■■■■■ 4.87
CC2D2AQ9P2K1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
CC2D2AQ9P2K1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC45.46■■■■■ 4.87
CC2D2AQ9P2K1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC45.46■■■■■ 4.87
CC2D2AQ9P2K1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.46■■■■■ 4.87
CC2D2AQ9P2K1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
CC2D2AQ9P2K1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC45.45■■■■■ 4.87
CC2D2AQ9P2K1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.87
CC2D2AQ9P2K1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.87
CC2D2AQ9P2K1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC45.44■■■■■ 4.87
CC2D2AQ9P2K1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.87
CC2D2AQ9P2K1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC45.44■■■■■ 4.87
CC2D2AQ9P2K1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.86
CC2D2AQ9P2K1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC45.44■■■■■ 4.86
CC2D2AQ9P2K1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC45.44■■■■■ 4.86
CC2D2AQ9P2K1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC45.44■■■■■ 4.86
CC2D2AQ9P2K1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.43■■■■■ 4.86
CC2D2AQ9P2K1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC45.43■■■■■ 4.86
CC2D2AQ9P2K1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC45.42■■■■■ 4.86
CC2D2AQ9P2K1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC45.42■■■■■ 4.86
CC2D2AQ9P2K1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC45.41■■■■■ 4.86
CC2D2AQ9P2K1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC45.41■■■■■ 4.86
CC2D2AQ9P2K1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
CC2D2AQ9P2K1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
CC2D2AQ9P2K1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
CC2D2AQ9P2K1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC45.39■■■■■ 4.86
CC2D2AQ9P2K1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC45.39■■■■■ 4.86
CC2D2AQ9P2K1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC45.38■■■■■ 4.86
CC2D2AQ9P2K1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
CC2D2AQ9P2K1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
CC2D2AQ9P2K1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.85
CC2D2AQ9P2K1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
CC2D2AQ9P2K1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC45.37■■■■■ 4.85
CC2D2AQ9P2K1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC45.37■■■■■ 4.85
CC2D2AQ9P2K1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC45.37■■■■■ 4.85
CC2D2AQ9P2K1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC45.36■■■■■ 4.85
CC2D2AQ9P2K1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC45.35■■■■■ 4.85
CC2D2AQ9P2K1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
CC2D2AQ9P2K1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC45.35■■■■■ 4.85
CC2D2AQ9P2K1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC45.34■■■■■ 4.85
CC2D2AQ9P2K1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC45.34■■■■■ 4.85
CC2D2AQ9P2K1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
CC2D2AQ9P2K1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC45.33■■■■■ 4.85
CC2D2AQ9P2K1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
CC2D2AQ9P2K1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
CC2D2AQ9P2K1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
CC2D2AQ9P2K1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.3■■■■■ 4.84
CC2D2AQ9P2K1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
CC2D2AQ9P2K1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
CC2D2AQ9P2K1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
CC2D2AQ9P2K1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
CC2D2AQ9P2K1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC45.28■■■■■ 4.84
CC2D2AQ9P2K1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
CC2D2AQ9P2K1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
CC2D2AQ9P2K1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC45.28■■■■■ 4.84
CC2D2AQ9P2K1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
CC2D2AQ9P2K1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
CC2D2AQ9P2K1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC45.27■■■■■ 4.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142 ms