Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG7

SDR39U1, Epimerase family protein SDR39U1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR39U1Q9NRG7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDR39U1Q9NRG7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDR39U1Q9NRG7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDR39U1Q9NRG7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SDR39U1Q9NRG7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDR39U1Q9NRG7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDR39U1Q9NRG7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SDR39U1Q9NRG7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDR39U1Q9NRG7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDR39U1Q9NRG7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDR39U1Q9NRG7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDR39U1Q9NRG7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDR39U1Q9NRG7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDR39U1Q9NRG7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDR39U1Q9NRG7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDR39U1Q9NRG7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDR39U1Q9NRG7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDR39U1Q9NRG7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDR39U1Q9NRG7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDR39U1Q9NRG7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDR39U1Q9NRG7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDR39U1Q9NRG7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDR39U1Q9NRG7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDR39U1Q9NRG7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDR39U1Q9NRG7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDR39U1Q9NRG7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDR39U1Q9NRG7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDR39U1Q9NRG7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDR39U1Q9NRG7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDR39U1Q9NRG7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDR39U1Q9NRG7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDR39U1Q9NRG7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDR39U1Q9NRG7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDR39U1Q9NRG7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDR39U1Q9NRG7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDR39U1Q9NRG7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDR39U1Q9NRG7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDR39U1Q9NRG7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDR39U1Q9NRG7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDR39U1Q9NRG7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDR39U1Q9NRG7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDR39U1Q9NRG7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDR39U1Q9NRG7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDR39U1Q9NRG7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDR39U1Q9NRG7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDR39U1Q9NRG7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDR39U1Q9NRG7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDR39U1Q9NRG7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SDR39U1Q9NRG7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDR39U1Q9NRG7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SDR39U1Q9NRG7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SDR39U1Q9NRG7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SDR39U1Q9NRG7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDR39U1Q9NRG7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDR39U1Q9NRG7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDR39U1Q9NRG7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDR39U1Q9NRG7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDR39U1Q9NRG7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDR39U1Q9NRG7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDR39U1Q9NRG7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDR39U1Q9NRG7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDR39U1Q9NRG7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDR39U1Q9NRG7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDR39U1Q9NRG7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDR39U1Q9NRG7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDR39U1Q9NRG7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDR39U1Q9NRG7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDR39U1Q9NRG7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDR39U1Q9NRG7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDR39U1Q9NRG7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDR39U1Q9NRG7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDR39U1Q9NRG7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDR39U1Q9NRG7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDR39U1Q9NRG7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDR39U1Q9NRG7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SDR39U1Q9NRG7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDR39U1Q9NRG7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDR39U1Q9NRG7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDR39U1Q9NRG7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDR39U1Q9NRG7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDR39U1Q9NRG7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDR39U1Q9NRG7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDR39U1Q9NRG7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDR39U1Q9NRG7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SDR39U1Q9NRG7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDR39U1Q9NRG7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDR39U1Q9NRG7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDR39U1Q9NRG7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDR39U1Q9NRG7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDR39U1Q9NRG7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDR39U1Q9NRG7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDR39U1Q9NRG7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDR39U1Q9NRG7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDR39U1Q9NRG7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDR39U1Q9NRG7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDR39U1Q9NRG7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDR39U1Q9NRG7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDR39U1Q9NRG7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDR39U1Q9NRG7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDR39U1Q9NRG7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms