Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNB1IP1Q9NPC3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNB1IP1Q9NPC3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNB1IP1Q9NPC3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNB1IP1Q9NPC3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNB1IP1Q9NPC3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNB1IP1Q9NPC3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNB1IP1Q9NPC3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNB1IP1Q9NPC3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNB1IP1Q9NPC3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNB1IP1Q9NPC3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNB1IP1Q9NPC3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNB1IP1Q9NPC3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNB1IP1Q9NPC3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNB1IP1Q9NPC3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNB1IP1Q9NPC3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNB1IP1Q9NPC3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNB1IP1Q9NPC3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNB1IP1Q9NPC3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNB1IP1Q9NPC3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNB1IP1Q9NPC3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNB1IP1Q9NPC3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNB1IP1Q9NPC3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNB1IP1Q9NPC3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNB1IP1Q9NPC3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNB1IP1Q9NPC3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNB1IP1Q9NPC3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNB1IP1Q9NPC3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNB1IP1Q9NPC3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNB1IP1Q9NPC3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNB1IP1Q9NPC3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNB1IP1Q9NPC3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNB1IP1Q9NPC3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNB1IP1Q9NPC3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNB1IP1Q9NPC3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNB1IP1Q9NPC3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNB1IP1Q9NPC3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNB1IP1Q9NPC3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNB1IP1Q9NPC3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNB1IP1Q9NPC3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNB1IP1Q9NPC3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNB1IP1Q9NPC3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNB1IP1Q9NPC3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNB1IP1Q9NPC3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNB1IP1Q9NPC3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNB1IP1Q9NPC3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNB1IP1Q9NPC3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNB1IP1Q9NPC3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNB1IP1Q9NPC3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNB1IP1Q9NPC3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNB1IP1Q9NPC3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNB1IP1Q9NPC3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNB1IP1Q9NPC3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNB1IP1Q9NPC3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNB1IP1Q9NPC3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms