Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIAA1549Q9HCM3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIAA1549Q9HCM3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIAA1549Q9HCM3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIAA1549Q9HCM3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIAA1549Q9HCM3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIAA1549Q9HCM3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIAA1549Q9HCM3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIAA1549Q9HCM3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIAA1549Q9HCM3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIAA1549Q9HCM3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIAA1549Q9HCM3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIAA1549Q9HCM3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIAA1549Q9HCM3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIAA1549Q9HCM3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIAA1549Q9HCM3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KIAA1549Q9HCM3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIAA1549Q9HCM3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIAA1549Q9HCM3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIAA1549Q9HCM3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIAA1549Q9HCM3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIAA1549Q9HCM3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KIAA1549Q9HCM3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIAA1549Q9HCM3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIAA1549Q9HCM3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIAA1549Q9HCM3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIAA1549Q9HCM3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIAA1549Q9HCM3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIAA1549Q9HCM3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KIAA1549Q9HCM3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIAA1549Q9HCM3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIAA1549Q9HCM3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIAA1549Q9HCM3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIAA1549Q9HCM3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIAA1549Q9HCM3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIAA1549Q9HCM3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIAA1549Q9HCM3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1549Q9HCM3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1549Q9HCM3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1549Q9HCM3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1549Q9HCM3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1549Q9HCM3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KIAA1549Q9HCM3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KIAA1549Q9HCM3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KIAA1549Q9HCM3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KIAA1549Q9HCM3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIAA1549Q9HCM3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIAA1549Q9HCM3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIAA1549Q9HCM3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIAA1549Q9HCM3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIAA1549Q9HCM3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1549Q9HCM3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1549Q9HCM3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1549Q9HCM3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms