Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBV1

POPDC3, Popeye domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POPDC3Q9HBV1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POPDC3Q9HBV1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POPDC3Q9HBV1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POPDC3Q9HBV1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POPDC3Q9HBV1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POPDC3Q9HBV1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POPDC3Q9HBV1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POPDC3Q9HBV1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POPDC3Q9HBV1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POPDC3Q9HBV1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POPDC3Q9HBV1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POPDC3Q9HBV1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POPDC3Q9HBV1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POPDC3Q9HBV1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POPDC3Q9HBV1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POPDC3Q9HBV1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
POPDC3Q9HBV1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POPDC3Q9HBV1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POPDC3Q9HBV1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POPDC3Q9HBV1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POPDC3Q9HBV1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POPDC3Q9HBV1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POPDC3Q9HBV1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POPDC3Q9HBV1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POPDC3Q9HBV1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POPDC3Q9HBV1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POPDC3Q9HBV1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POPDC3Q9HBV1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
POPDC3Q9HBV1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
POPDC3Q9HBV1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POPDC3Q9HBV1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
POPDC3Q9HBV1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POPDC3Q9HBV1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POPDC3Q9HBV1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POPDC3Q9HBV1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POPDC3Q9HBV1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POPDC3Q9HBV1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POPDC3Q9HBV1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POPDC3Q9HBV1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POPDC3Q9HBV1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POPDC3Q9HBV1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POPDC3Q9HBV1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POPDC3Q9HBV1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POPDC3Q9HBV1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POPDC3Q9HBV1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POPDC3Q9HBV1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POPDC3Q9HBV1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POPDC3Q9HBV1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POPDC3Q9HBV1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POPDC3Q9HBV1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POPDC3Q9HBV1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POPDC3Q9HBV1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POPDC3Q9HBV1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POPDC3Q9HBV1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POPDC3Q9HBV1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POPDC3Q9HBV1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POPDC3Q9HBV1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POPDC3Q9HBV1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POPDC3Q9HBV1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POPDC3Q9HBV1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POPDC3Q9HBV1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POPDC3Q9HBV1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POPDC3Q9HBV1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POPDC3Q9HBV1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POPDC3Q9HBV1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POPDC3Q9HBV1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POPDC3Q9HBV1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POPDC3Q9HBV1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
POPDC3Q9HBV1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POPDC3Q9HBV1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POPDC3Q9HBV1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POPDC3Q9HBV1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
POPDC3Q9HBV1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POPDC3Q9HBV1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POPDC3Q9HBV1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POPDC3Q9HBV1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POPDC3Q9HBV1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POPDC3Q9HBV1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POPDC3Q9HBV1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POPDC3Q9HBV1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POPDC3Q9HBV1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POPDC3Q9HBV1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
POPDC3Q9HBV1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
POPDC3Q9HBV1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
POPDC3Q9HBV1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POPDC3Q9HBV1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POPDC3Q9HBV1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POPDC3Q9HBV1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POPDC3Q9HBV1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POPDC3Q9HBV1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POPDC3Q9HBV1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POPDC3Q9HBV1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POPDC3Q9HBV1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POPDC3Q9HBV1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POPDC3Q9HBV1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POPDC3Q9HBV1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POPDC3Q9HBV1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POPDC3Q9HBV1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POPDC3Q9HBV1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POPDC3Q9HBV1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms