Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0G0

ZNF407, Zinc finger protein 407, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF407Q9C0G0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF407Q9C0G0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF407Q9C0G0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF407Q9C0G0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF407Q9C0G0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF407Q9C0G0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF407Q9C0G0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF407Q9C0G0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF407Q9C0G0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF407Q9C0G0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF407Q9C0G0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF407Q9C0G0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF407Q9C0G0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF407Q9C0G0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF407Q9C0G0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF407Q9C0G0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF407Q9C0G0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF407Q9C0G0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF407Q9C0G0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF407Q9C0G0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF407Q9C0G0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF407Q9C0G0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF407Q9C0G0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF407Q9C0G0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF407Q9C0G0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF407Q9C0G0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF407Q9C0G0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF407Q9C0G0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF407Q9C0G0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF407Q9C0G0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF407Q9C0G0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF407Q9C0G0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF407Q9C0G0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF407Q9C0G0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF407Q9C0G0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF407Q9C0G0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF407Q9C0G0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF407Q9C0G0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF407Q9C0G0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF407Q9C0G0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF407Q9C0G0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF407Q9C0G0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF407Q9C0G0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF407Q9C0G0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF407Q9C0G0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF407Q9C0G0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF407Q9C0G0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF407Q9C0G0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF407Q9C0G0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF407Q9C0G0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF407Q9C0G0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF407Q9C0G0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF407Q9C0G0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF407Q9C0G0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF407Q9C0G0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF407Q9C0G0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF407Q9C0G0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF407Q9C0G0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF407Q9C0G0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF407Q9C0G0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF407Q9C0G0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF407Q9C0G0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF407Q9C0G0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF407Q9C0G0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF407Q9C0G0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF407Q9C0G0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF407Q9C0G0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF407Q9C0G0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF407Q9C0G0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF407Q9C0G0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF407Q9C0G0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF407Q9C0G0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF407Q9C0G0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF407Q9C0G0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF407Q9C0G0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF407Q9C0G0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF407Q9C0G0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF407Q9C0G0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF407Q9C0G0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF407Q9C0G0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF407Q9C0G0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF407Q9C0G0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF407Q9C0G0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF407Q9C0G0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF407Q9C0G0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF407Q9C0G0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF407Q9C0G0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF407Q9C0G0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF407Q9C0G0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF407Q9C0G0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF407Q9C0G0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF407Q9C0G0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF407Q9C0G0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF407Q9C0G0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF407Q9C0G0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF407Q9C0G0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF407Q9C0G0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF407Q9C0G0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF407Q9C0G0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF407Q9C0G0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms