Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXQ1Q9C009 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXQ1Q9C009 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXQ1Q9C009 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXQ1Q9C009 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXQ1Q9C009 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXQ1Q9C009 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXQ1Q9C009 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXQ1Q9C009 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXQ1Q9C009 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXQ1Q9C009 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXQ1Q9C009 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXQ1Q9C009 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXQ1Q9C009 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXQ1Q9C009 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXQ1Q9C009 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXQ1Q9C009 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXQ1Q9C009 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXQ1Q9C009 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXQ1Q9C009 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXQ1Q9C009 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXQ1Q9C009 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXQ1Q9C009 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
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