Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
SYCP2Q9BX26 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
SYCP2Q9BX26 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
SYCP2Q9BX26 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
SYCP2Q9BX26 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
SYCP2Q9BX26 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
SYCP2Q9BX26 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
SYCP2Q9BX26 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
SYCP2Q9BX26 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
SYCP2Q9BX26 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
SYCP2Q9BX26 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
SYCP2Q9BX26 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
SYCP2Q9BX26 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
SYCP2Q9BX26 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
SYCP2Q9BX26 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
SYCP2Q9BX26 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
SYCP2Q9BX26 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
SYCP2Q9BX26 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.61
SYCP2Q9BX26 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.61
SYCP2Q9BX26 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC37.57■■■■□ 3.6
SYCP2Q9BX26 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
SYCP2Q9BX26 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
SYCP2Q9BX26 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
SYCP2Q9BX26 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
SYCP2Q9BX26 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
SYCP2Q9BX26 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
SYCP2Q9BX26 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
SYCP2Q9BX26 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
SYCP2Q9BX26 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
SYCP2Q9BX26 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
SYCP2Q9BX26 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
SYCP2Q9BX26 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
SYCP2Q9BX26 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
SYCP2Q9BX26 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
SYCP2Q9BX26 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
SYCP2Q9BX26 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
SYCP2Q9BX26 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
SYCP2Q9BX26 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SYCP2Q9BX26 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SYCP2Q9BX26 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
SYCP2Q9BX26 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
SYCP2Q9BX26 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
SYCP2Q9BX26 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
SYCP2Q9BX26 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
SYCP2Q9BX26 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC37.49■■■■□ 3.59
SYCP2Q9BX26 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
SYCP2Q9BX26 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
SYCP2Q9BX26 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
SYCP2Q9BX26 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
SYCP2Q9BX26 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
SYCP2Q9BX26 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC37.49■■■■□ 3.59
SYCP2Q9BX26 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC37.49■■■■□ 3.59
SYCP2Q9BX26 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
SYCP2Q9BX26 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
SYCP2Q9BX26 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
SYCP2Q9BX26 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SYCP2Q9BX26 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SYCP2Q9BX26 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SYCP2Q9BX26 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
SYCP2Q9BX26 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
SYCP2Q9BX26 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
SYCP2Q9BX26 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
SYCP2Q9BX26 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
SYCP2Q9BX26 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
SYCP2Q9BX26 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
SYCP2Q9BX26 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SYCP2Q9BX26 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SYCP2Q9BX26 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
SYCP2Q9BX26 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SYCP2Q9BX26 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
SYCP2Q9BX26 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
SYCP2Q9BX26 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC37.41■■■■□ 3.58
SYCP2Q9BX26 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
SYCP2Q9BX26 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
SYCP2Q9BX26 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
SYCP2Q9BX26 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
SYCP2Q9BX26 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
SYCP2Q9BX26 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SYCP2Q9BX26 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SYCP2Q9BX26 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SYCP2Q9BX26 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SYCP2Q9BX26 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SYCP2Q9BX26 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
SYCP2Q9BX26 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
SYCP2Q9BX26 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
SYCP2Q9BX26 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
SYCP2Q9BX26 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
SYCP2Q9BX26 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
SYCP2Q9BX26 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
SYCP2Q9BX26 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
SYCP2Q9BX26 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
SYCP2Q9BX26 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
SYCP2Q9BX26 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SYCP2Q9BX26 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
SYCP2Q9BX26 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SYCP2Q9BX26 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
SYCP2Q9BX26 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
SYCP2Q9BX26 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
SYCP2Q9BX26 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
SYCP2Q9BX26 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms