Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSBP4Q9BWG4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP4Q9BWG4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP4Q9BWG4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms