Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG101Q9BSB4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG101Q9BSB4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG101Q9BSB4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG101Q9BSB4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG101Q9BSB4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG101Q9BSB4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG101Q9BSB4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG101Q9BSB4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG101Q9BSB4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG101Q9BSB4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG101Q9BSB4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG101Q9BSB4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG101Q9BSB4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG101Q9BSB4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG101Q9BSB4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG101Q9BSB4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG101Q9BSB4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG101Q9BSB4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG101Q9BSB4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG101Q9BSB4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG101Q9BSB4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG101Q9BSB4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG101Q9BSB4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG101Q9BSB4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG101Q9BSB4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG101Q9BSB4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG101Q9BSB4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG101Q9BSB4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG101Q9BSB4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG101Q9BSB4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG101Q9BSB4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG101Q9BSB4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG101Q9BSB4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG101Q9BSB4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG101Q9BSB4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG101Q9BSB4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG101Q9BSB4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG101Q9BSB4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG101Q9BSB4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATG101Q9BSB4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATG101Q9BSB4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG101Q9BSB4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms