Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GINS3Q9BRX5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
GINS3Q9BRX5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GINS3Q9BRX5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GINS3Q9BRX5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GINS3Q9BRX5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GINS3Q9BRX5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GINS3Q9BRX5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GINS3Q9BRX5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GINS3Q9BRX5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GINS3Q9BRX5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GINS3Q9BRX5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GINS3Q9BRX5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GINS3Q9BRX5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GINS3Q9BRX5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GINS3Q9BRX5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GINS3Q9BRX5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GINS3Q9BRX5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GINS3Q9BRX5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GINS3Q9BRX5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GINS3Q9BRX5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GINS3Q9BRX5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GINS3Q9BRX5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GINS3Q9BRX5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GINS3Q9BRX5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GINS3Q9BRX5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GINS3Q9BRX5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GINS3Q9BRX5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GINS3Q9BRX5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GINS3Q9BRX5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GINS3Q9BRX5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GINS3Q9BRX5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GINS3Q9BRX5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GINS3Q9BRX5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GINS3Q9BRX5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GINS3Q9BRX5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
GINS3Q9BRX5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GINS3Q9BRX5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GINS3Q9BRX5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GINS3Q9BRX5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GINS3Q9BRX5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GINS3Q9BRX5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GINS3Q9BRX5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GINS3Q9BRX5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GINS3Q9BRX5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms