Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPPED1Q9BRF8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPPED1Q9BRF8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPPED1Q9BRF8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPPED1Q9BRF8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CPPED1Q9BRF8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CPPED1Q9BRF8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPPED1Q9BRF8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPPED1Q9BRF8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPPED1Q9BRF8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPPED1Q9BRF8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPPED1Q9BRF8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPPED1Q9BRF8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CPPED1Q9BRF8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPPED1Q9BRF8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPPED1Q9BRF8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPPED1Q9BRF8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPPED1Q9BRF8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPPED1Q9BRF8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPPED1Q9BRF8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPPED1Q9BRF8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPPED1Q9BRF8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPPED1Q9BRF8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPPED1Q9BRF8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPPED1Q9BRF8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPPED1Q9BRF8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPPED1Q9BRF8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPPED1Q9BRF8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPPED1Q9BRF8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPPED1Q9BRF8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPPED1Q9BRF8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPPED1Q9BRF8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPPED1Q9BRF8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPPED1Q9BRF8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPPED1Q9BRF8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPPED1Q9BRF8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPPED1Q9BRF8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPPED1Q9BRF8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPPED1Q9BRF8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPPED1Q9BRF8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CPPED1Q9BRF8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPPED1Q9BRF8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPPED1Q9BRF8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPPED1Q9BRF8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CPPED1Q9BRF8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CPPED1Q9BRF8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CPPED1Q9BRF8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CPPED1Q9BRF8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CPPED1Q9BRF8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPPED1Q9BRF8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPPED1Q9BRF8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPPED1Q9BRF8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPPED1Q9BRF8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPPED1Q9BRF8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPPED1Q9BRF8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPPED1Q9BRF8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPPED1Q9BRF8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPPED1Q9BRF8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPPED1Q9BRF8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPPED1Q9BRF8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPPED1Q9BRF8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPPED1Q9BRF8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPPED1Q9BRF8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPPED1Q9BRF8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPPED1Q9BRF8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPPED1Q9BRF8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPPED1Q9BRF8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPPED1Q9BRF8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPPED1Q9BRF8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPPED1Q9BRF8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPPED1Q9BRF8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPPED1Q9BRF8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPPED1Q9BRF8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPPED1Q9BRF8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPPED1Q9BRF8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPPED1Q9BRF8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPPED1Q9BRF8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPPED1Q9BRF8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPPED1Q9BRF8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPPED1Q9BRF8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPPED1Q9BRF8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPPED1Q9BRF8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPPED1Q9BRF8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPPED1Q9BRF8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPPED1Q9BRF8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPPED1Q9BRF8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPPED1Q9BRF8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CPPED1Q9BRF8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPPED1Q9BRF8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPPED1Q9BRF8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPPED1Q9BRF8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPPED1Q9BRF8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPPED1Q9BRF8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPPED1Q9BRF8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPPED1Q9BRF8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPPED1Q9BRF8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CPPED1Q9BRF8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPPED1Q9BRF8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPPED1Q9BRF8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPPED1Q9BRF8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.9 ms