Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQN1

FAM83C, Protein FAM83C, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM83CQ9BQN1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM83CQ9BQN1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM83CQ9BQN1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM83CQ9BQN1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM83CQ9BQN1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM83CQ9BQN1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM83CQ9BQN1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM83CQ9BQN1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM83CQ9BQN1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM83CQ9BQN1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM83CQ9BQN1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM83CQ9BQN1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM83CQ9BQN1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM83CQ9BQN1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM83CQ9BQN1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM83CQ9BQN1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM83CQ9BQN1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM83CQ9BQN1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM83CQ9BQN1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM83CQ9BQN1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM83CQ9BQN1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM83CQ9BQN1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM83CQ9BQN1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM83CQ9BQN1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM83CQ9BQN1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM83CQ9BQN1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM83CQ9BQN1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM83CQ9BQN1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM83CQ9BQN1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM83CQ9BQN1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM83CQ9BQN1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM83CQ9BQN1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM83CQ9BQN1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM83CQ9BQN1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM83CQ9BQN1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM83CQ9BQN1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM83CQ9BQN1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM83CQ9BQN1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM83CQ9BQN1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM83CQ9BQN1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM83CQ9BQN1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM83CQ9BQN1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM83CQ9BQN1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM83CQ9BQN1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM83CQ9BQN1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM83CQ9BQN1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM83CQ9BQN1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM83CQ9BQN1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM83CQ9BQN1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM83CQ9BQN1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM83CQ9BQN1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM83CQ9BQN1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM83CQ9BQN1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM83CQ9BQN1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM83CQ9BQN1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM83CQ9BQN1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.2 ms