Protein–RNA interactions for Protein: Q96T68

SETDB2, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB2, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETDB2Q96T68 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
SETDB2Q96T68 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SETDB2Q96T68 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SETDB2Q96T68 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SETDB2Q96T68 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SETDB2Q96T68 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SETDB2Q96T68 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SETDB2Q96T68 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SETDB2Q96T68 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SETDB2Q96T68 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SETDB2Q96T68 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SETDB2Q96T68 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SETDB2Q96T68 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SETDB2Q96T68 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SETDB2Q96T68 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SETDB2Q96T68 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SETDB2Q96T68 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SETDB2Q96T68 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SETDB2Q96T68 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SETDB2Q96T68 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SETDB2Q96T68 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SETDB2Q96T68 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SETDB2Q96T68 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
SETDB2Q96T68 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SETDB2Q96T68 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SETDB2Q96T68 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SETDB2Q96T68 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SETDB2Q96T68 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SETDB2Q96T68 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SETDB2Q96T68 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SETDB2Q96T68 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SETDB2Q96T68 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SETDB2Q96T68 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SETDB2Q96T68 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
SETDB2Q96T68 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SETDB2Q96T68 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
SETDB2Q96T68 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SETDB2Q96T68 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SETDB2Q96T68 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SETDB2Q96T68 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SETDB2Q96T68 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
SETDB2Q96T68 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SETDB2Q96T68 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SETDB2Q96T68 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SETDB2Q96T68 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
SETDB2Q96T68 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SETDB2Q96T68 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SETDB2Q96T68 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SETDB2Q96T68 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SETDB2Q96T68 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
SETDB2Q96T68 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SETDB2Q96T68 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SETDB2Q96T68 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
SETDB2Q96T68 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SETDB2Q96T68 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC31■■■□□ 2.55
SETDB2Q96T68 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SETDB2Q96T68 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SETDB2Q96T68 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SETDB2Q96T68 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SETDB2Q96T68 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SETDB2Q96T68 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SETDB2Q96T68 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SETDB2Q96T68 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SETDB2Q96T68 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
SETDB2Q96T68 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SETDB2Q96T68 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SETDB2Q96T68 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SETDB2Q96T68 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SETDB2Q96T68 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SETDB2Q96T68 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SETDB2Q96T68 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SETDB2Q96T68 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SETDB2Q96T68 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SETDB2Q96T68 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
SETDB2Q96T68 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SETDB2Q96T68 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SETDB2Q96T68 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SETDB2Q96T68 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SETDB2Q96T68 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SETDB2Q96T68 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SETDB2Q96T68 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SETDB2Q96T68 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SETDB2Q96T68 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SETDB2Q96T68 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SETDB2Q96T68 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
SETDB2Q96T68 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SETDB2Q96T68 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SETDB2Q96T68 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SETDB2Q96T68 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SETDB2Q96T68 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SETDB2Q96T68 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SETDB2Q96T68 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SETDB2Q96T68 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SETDB2Q96T68 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SETDB2Q96T68 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SETDB2Q96T68 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SETDB2Q96T68 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SETDB2Q96T68 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SETDB2Q96T68 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SETDB2Q96T68 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms