Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UIMC1Q96RL1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
UIMC1Q96RL1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UIMC1Q96RL1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
UIMC1Q96RL1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
UIMC1Q96RL1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UIMC1Q96RL1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UIMC1Q96RL1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UIMC1Q96RL1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UIMC1Q96RL1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UIMC1Q96RL1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UIMC1Q96RL1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UIMC1Q96RL1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UIMC1Q96RL1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UIMC1Q96RL1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UIMC1Q96RL1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UIMC1Q96RL1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
UIMC1Q96RL1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UIMC1Q96RL1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UIMC1Q96RL1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
UIMC1Q96RL1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
UIMC1Q96RL1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
UIMC1Q96RL1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UIMC1Q96RL1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
UIMC1Q96RL1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UIMC1Q96RL1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
UIMC1Q96RL1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
UIMC1Q96RL1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
UIMC1Q96RL1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
UIMC1Q96RL1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
UIMC1Q96RL1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UIMC1Q96RL1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UIMC1Q96RL1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UIMC1Q96RL1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UIMC1Q96RL1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UIMC1Q96RL1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UIMC1Q96RL1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
UIMC1Q96RL1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UIMC1Q96RL1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UIMC1Q96RL1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UIMC1Q96RL1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
UIMC1Q96RL1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UIMC1Q96RL1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UIMC1Q96RL1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UIMC1Q96RL1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UIMC1Q96RL1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UIMC1Q96RL1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UIMC1Q96RL1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UIMC1Q96RL1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
UIMC1Q96RL1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UIMC1Q96RL1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UIMC1Q96RL1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UIMC1Q96RL1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UIMC1Q96RL1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UIMC1Q96RL1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UIMC1Q96RL1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UIMC1Q96RL1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UIMC1Q96RL1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
UIMC1Q96RL1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
UIMC1Q96RL1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
UIMC1Q96RL1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
UIMC1Q96RL1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
UIMC1Q96RL1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
UIMC1Q96RL1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UIMC1Q96RL1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UIMC1Q96RL1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UIMC1Q96RL1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
UIMC1Q96RL1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
UIMC1Q96RL1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
UIMC1Q96RL1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UIMC1Q96RL1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UIMC1Q96RL1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UIMC1Q96RL1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UIMC1Q96RL1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
UIMC1Q96RL1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UIMC1Q96RL1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
UIMC1Q96RL1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
UIMC1Q96RL1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UIMC1Q96RL1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UIMC1Q96RL1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
UIMC1Q96RL1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
UIMC1Q96RL1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UIMC1Q96RL1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
UIMC1Q96RL1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UIMC1Q96RL1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UIMC1Q96RL1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UIMC1Q96RL1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UIMC1Q96RL1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UIMC1Q96RL1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UIMC1Q96RL1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UIMC1Q96RL1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UIMC1Q96RL1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UIMC1Q96RL1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
UIMC1Q96RL1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
UIMC1Q96RL1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UIMC1Q96RL1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UIMC1Q96RL1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UIMC1Q96RL1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
UIMC1Q96RL1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UIMC1Q96RL1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms