Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SORCS2Q96PQ0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SORCS2Q96PQ0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SORCS2Q96PQ0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SORCS2Q96PQ0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SORCS2Q96PQ0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SORCS2Q96PQ0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SORCS2Q96PQ0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SORCS2Q96PQ0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SORCS2Q96PQ0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SORCS2Q96PQ0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SORCS2Q96PQ0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SORCS2Q96PQ0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SORCS2Q96PQ0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SORCS2Q96PQ0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SORCS2Q96PQ0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SORCS2Q96PQ0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SORCS2Q96PQ0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SORCS2Q96PQ0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SORCS2Q96PQ0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SORCS2Q96PQ0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SORCS2Q96PQ0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SORCS2Q96PQ0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SORCS2Q96PQ0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SORCS2Q96PQ0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SORCS2Q96PQ0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SORCS2Q96PQ0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SORCS2Q96PQ0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SORCS2Q96PQ0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SORCS2Q96PQ0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SORCS2Q96PQ0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SORCS2Q96PQ0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SORCS2Q96PQ0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SORCS2Q96PQ0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SORCS2Q96PQ0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SORCS2Q96PQ0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SORCS2Q96PQ0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SORCS2Q96PQ0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SORCS2Q96PQ0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SORCS2Q96PQ0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SORCS2Q96PQ0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SORCS2Q96PQ0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SORCS2Q96PQ0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms