Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPRD1AQ96P16 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPRD1AQ96P16 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPRD1AQ96P16 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPRD1AQ96P16 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPRD1AQ96P16 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPRD1AQ96P16 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPRD1AQ96P16 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPRD1AQ96P16 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPRD1AQ96P16 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPRD1AQ96P16 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPRD1AQ96P16 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RPRD1AQ96P16 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPRD1AQ96P16 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPRD1AQ96P16 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPRD1AQ96P16 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPRD1AQ96P16 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPRD1AQ96P16 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPRD1AQ96P16 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPRD1AQ96P16 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPRD1AQ96P16 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPRD1AQ96P16 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPRD1AQ96P16 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RPRD1AQ96P16 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPRD1AQ96P16 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPRD1AQ96P16 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPRD1AQ96P16 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RPRD1AQ96P16 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RPRD1AQ96P16 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPRD1AQ96P16 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPRD1AQ96P16 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPRD1AQ96P16 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPRD1AQ96P16 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPRD1AQ96P16 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPRD1AQ96P16 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPRD1AQ96P16 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPRD1AQ96P16 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPRD1AQ96P16 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RPRD1AQ96P16 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPRD1AQ96P16 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPRD1AQ96P16 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPRD1AQ96P16 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPRD1AQ96P16 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPRD1AQ96P16 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPRD1AQ96P16 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPRD1AQ96P16 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPRD1AQ96P16 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RPRD1AQ96P16 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RPRD1AQ96P16 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPRD1AQ96P16 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPRD1AQ96P16 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPRD1AQ96P16 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPRD1AQ96P16 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPRD1AQ96P16 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPRD1AQ96P16 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPRD1AQ96P16 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPRD1AQ96P16 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms