Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF0

Putative uncharacterized protein LOC100506887, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q96MF0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Q96MF0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q96MF0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q96MF0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q96MF0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q96MF0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q96MF0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q96MF0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Q96MF0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q96MF0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q96MF0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q96MF0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q96MF0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q96MF0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Q96MF0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q96MF0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q96MF0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q96MF0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q96MF0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q96MF0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q96MF0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q96MF0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q96MF0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q96MF0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q96MF0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q96MF0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q96MF0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q96MF0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q96MF0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q96MF0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q96MF0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q96MF0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q96MF0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q96MF0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Q96MF0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q96MF0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q96MF0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q96MF0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q96MF0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q96MF0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Q96MF0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q96MF0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q96MF0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q96MF0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q96MF0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q96MF0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q96MF0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q96MF0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q96MF0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q96MF0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q96MF0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q96MF0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q96MF0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q96MF0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q96MF0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q96MF0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q96MF0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Q96MF0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Q96MF0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q96MF0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q96MF0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q96MF0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q96MF0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q96MF0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q96MF0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q96MF0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q96MF0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q96MF0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q96MF0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q96MF0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Q96MF0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q96MF0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q96MF0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q96MF0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Q96MF0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q96MF0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q96MF0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Q96MF0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q96MF0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Q96MF0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Q96MF0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q96MF0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q96MF0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q96MF0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q96MF0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q96MF0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q96MF0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q96MF0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q96MF0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q96MF0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q96MF0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q96MF0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q96MF0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q96MF0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q96MF0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q96MF0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q96MF0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q96MF0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q96MF0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q96MF0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms