Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SYTL4Q96C24 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SYTL4Q96C24 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SYTL4Q96C24 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
SYTL4Q96C24 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SYTL4Q96C24 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SYTL4Q96C24 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SYTL4Q96C24 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SYTL4Q96C24 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SYTL4Q96C24 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SYTL4Q96C24 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
SYTL4Q96C24 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SYTL4Q96C24 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SYTL4Q96C24 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SYTL4Q96C24 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SYTL4Q96C24 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SYTL4Q96C24 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SYTL4Q96C24 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SYTL4Q96C24 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SYTL4Q96C24 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SYTL4Q96C24 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SYTL4Q96C24 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SYTL4Q96C24 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SYTL4Q96C24 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SYTL4Q96C24 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SYTL4Q96C24 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SYTL4Q96C24 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
SYTL4Q96C24 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SYTL4Q96C24 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SYTL4Q96C24 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SYTL4Q96C24 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SYTL4Q96C24 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SYTL4Q96C24 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SYTL4Q96C24 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SYTL4Q96C24 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SYTL4Q96C24 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SYTL4Q96C24 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SYTL4Q96C24 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SYTL4Q96C24 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
SYTL4Q96C24 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SYTL4Q96C24 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SYTL4Q96C24 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
SYTL4Q96C24 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SYTL4Q96C24 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SYTL4Q96C24 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SYTL4Q96C24 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SYTL4Q96C24 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SYTL4Q96C24 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
SYTL4Q96C24 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SYTL4Q96C24 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SYTL4Q96C24 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SYTL4Q96C24 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SYTL4Q96C24 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SYTL4Q96C24 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SYTL4Q96C24 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SYTL4Q96C24 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SYTL4Q96C24 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SYTL4Q96C24 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SYTL4Q96C24 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SYTL4Q96C24 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SYTL4Q96C24 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SYTL4Q96C24 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SYTL4Q96C24 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SYTL4Q96C24 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SYTL4Q96C24 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SYTL4Q96C24 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SYTL4Q96C24 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SYTL4Q96C24 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SYTL4Q96C24 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SYTL4Q96C24 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SYTL4Q96C24 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SYTL4Q96C24 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SYTL4Q96C24 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYTL4Q96C24 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYTL4Q96C24 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYTL4Q96C24 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYTL4Q96C24 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYTL4Q96C24 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYTL4Q96C24 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYTL4Q96C24 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYTL4Q96C24 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYTL4Q96C24 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYTL4Q96C24 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYTL4Q96C24 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYTL4Q96C24 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SYTL4Q96C24 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SYTL4Q96C24 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SYTL4Q96C24 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SYTL4Q96C24 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SYTL4Q96C24 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
SYTL4Q96C24 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SYTL4Q96C24 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SYTL4Q96C24 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SYTL4Q96C24 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SYTL4Q96C24 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SYTL4Q96C24 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
SYTL4Q96C24 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
SYTL4Q96C24 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SYTL4Q96C24 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SYTL4Q96C24 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms