Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GATAD2BQ8WXI9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GATAD2BQ8WXI9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GATAD2BQ8WXI9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GATAD2BQ8WXI9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GATAD2BQ8WXI9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GATAD2BQ8WXI9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GATAD2BQ8WXI9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GATAD2BQ8WXI9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GATAD2BQ8WXI9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GATAD2BQ8WXI9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GATAD2BQ8WXI9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GATAD2BQ8WXI9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GATAD2BQ8WXI9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GATAD2BQ8WXI9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GATAD2BQ8WXI9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GATAD2BQ8WXI9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GATAD2BQ8WXI9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GATAD2BQ8WXI9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GATAD2BQ8WXI9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GATAD2BQ8WXI9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GATAD2BQ8WXI9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GATAD2BQ8WXI9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GATAD2BQ8WXI9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GATAD2BQ8WXI9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GATAD2BQ8WXI9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GATAD2BQ8WXI9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GATAD2BQ8WXI9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GATAD2BQ8WXI9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GATAD2BQ8WXI9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GATAD2BQ8WXI9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GATAD2BQ8WXI9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GATAD2BQ8WXI9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GATAD2BQ8WXI9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GATAD2BQ8WXI9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GATAD2BQ8WXI9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GATAD2BQ8WXI9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GATAD2BQ8WXI9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GATAD2BQ8WXI9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GATAD2BQ8WXI9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GATAD2BQ8WXI9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GATAD2BQ8WXI9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GATAD2BQ8WXI9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GATAD2BQ8WXI9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GATAD2BQ8WXI9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GATAD2BQ8WXI9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GATAD2BQ8WXI9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GATAD2BQ8WXI9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GATAD2BQ8WXI9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GATAD2BQ8WXI9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GATAD2BQ8WXI9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GATAD2BQ8WXI9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GATAD2BQ8WXI9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GATAD2BQ8WXI9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GATAD2BQ8WXI9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GATAD2BQ8WXI9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GATAD2BQ8WXI9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GATAD2BQ8WXI9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GATAD2BQ8WXI9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GATAD2BQ8WXI9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GATAD2BQ8WXI9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GATAD2BQ8WXI9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GATAD2BQ8WXI9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GATAD2BQ8WXI9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GATAD2BQ8WXI9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GATAD2BQ8WXI9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GATAD2BQ8WXI9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GATAD2BQ8WXI9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GATAD2BQ8WXI9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GATAD2BQ8WXI9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GATAD2BQ8WXI9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GATAD2BQ8WXI9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GATAD2BQ8WXI9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GATAD2BQ8WXI9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GATAD2BQ8WXI9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GATAD2BQ8WXI9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GATAD2BQ8WXI9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms