Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C1orf54Q8WWF1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C1orf54Q8WWF1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C1orf54Q8WWF1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1orf54Q8WWF1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1orf54Q8WWF1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1orf54Q8WWF1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
C1orf54Q8WWF1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1orf54Q8WWF1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1orf54Q8WWF1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1orf54Q8WWF1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
C1orf54Q8WWF1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C1orf54Q8WWF1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C1orf54Q8WWF1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C1orf54Q8WWF1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C1orf54Q8WWF1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C1orf54Q8WWF1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1orf54Q8WWF1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1orf54Q8WWF1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1orf54Q8WWF1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1orf54Q8WWF1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1orf54Q8WWF1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C1orf54Q8WWF1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C1orf54Q8WWF1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C1orf54Q8WWF1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C1orf54Q8WWF1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C1orf54Q8WWF1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C1orf54Q8WWF1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1orf54Q8WWF1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1orf54Q8WWF1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1orf54Q8WWF1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
C1orf54Q8WWF1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1orf54Q8WWF1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1orf54Q8WWF1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1orf54Q8WWF1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1orf54Q8WWF1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1orf54Q8WWF1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C1orf54Q8WWF1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C1orf54Q8WWF1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
C1orf54Q8WWF1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C1orf54Q8WWF1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C1orf54Q8WWF1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C1orf54Q8WWF1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C1orf54Q8WWF1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C1orf54Q8WWF1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C1orf54Q8WWF1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C1orf54Q8WWF1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
C1orf54Q8WWF1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
C1orf54Q8WWF1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
C1orf54Q8WWF1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C1orf54Q8WWF1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms