Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC99

FNDC8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC8Q8TC99 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC8Q8TC99 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC8Q8TC99 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC8Q8TC99 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC8Q8TC99 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC8Q8TC99 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNDC8Q8TC99 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNDC8Q8TC99 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNDC8Q8TC99 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FNDC8Q8TC99 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FNDC8Q8TC99 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FNDC8Q8TC99 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FNDC8Q8TC99 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FNDC8Q8TC99 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FNDC8Q8TC99 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC8Q8TC99 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC8Q8TC99 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC8Q8TC99 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC8Q8TC99 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC8Q8TC99 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC8Q8TC99 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC8Q8TC99 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC8Q8TC99 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC8Q8TC99 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC8Q8TC99 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC8Q8TC99 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC8Q8TC99 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC8Q8TC99 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC8Q8TC99 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC8Q8TC99 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC8Q8TC99 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC8Q8TC99 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC8Q8TC99 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC8Q8TC99 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC8Q8TC99 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC8Q8TC99 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC8Q8TC99 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC8Q8TC99 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC8Q8TC99 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC8Q8TC99 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC8Q8TC99 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC8Q8TC99 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC8Q8TC99 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC8Q8TC99 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC8Q8TC99 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC8Q8TC99 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC8Q8TC99 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNDC8Q8TC99 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNDC8Q8TC99 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNDC8Q8TC99 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNDC8Q8TC99 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC8Q8TC99 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC8Q8TC99 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC8Q8TC99 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC8Q8TC99 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC8Q8TC99 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC8Q8TC99 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC8Q8TC99 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC8Q8TC99 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC8Q8TC99 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC8Q8TC99 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC8Q8TC99 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC8Q8TC99 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC8Q8TC99 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC8Q8TC99 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC8Q8TC99 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC8Q8TC99 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC8Q8TC99 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC8Q8TC99 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC8Q8TC99 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC8Q8TC99 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC8Q8TC99 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC8Q8TC99 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC8Q8TC99 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC8Q8TC99 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC8Q8TC99 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC8Q8TC99 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC8Q8TC99 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC8Q8TC99 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC8Q8TC99 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC8Q8TC99 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC8Q8TC99 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FNDC8Q8TC99 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNDC8Q8TC99 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNDC8Q8TC99 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNDC8Q8TC99 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC8Q8TC99 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC8Q8TC99 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC8Q8TC99 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC8Q8TC99 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC8Q8TC99 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC8Q8TC99 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC8Q8TC99 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC8Q8TC99 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC8Q8TC99 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC8Q8TC99 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC8Q8TC99 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC8Q8TC99 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC8Q8TC99 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC8Q8TC99 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms