Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
SYNE4Q8N205 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SYNE4Q8N205 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SYNE4Q8N205 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SYNE4Q8N205 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
SYNE4Q8N205 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SYNE4Q8N205 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SYNE4Q8N205 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SYNE4Q8N205 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
SYNE4Q8N205 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SYNE4Q8N205 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SYNE4Q8N205 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SYNE4Q8N205 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SYNE4Q8N205 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SYNE4Q8N205 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SYNE4Q8N205 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SYNE4Q8N205 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SYNE4Q8N205 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SYNE4Q8N205 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SYNE4Q8N205 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SYNE4Q8N205 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SYNE4Q8N205 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SYNE4Q8N205 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
SYNE4Q8N205 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SYNE4Q8N205 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SYNE4Q8N205 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SYNE4Q8N205 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
SYNE4Q8N205 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SYNE4Q8N205 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SYNE4Q8N205 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SYNE4Q8N205 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SYNE4Q8N205 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
SYNE4Q8N205 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SYNE4Q8N205 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SYNE4Q8N205 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SYNE4Q8N205 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SYNE4Q8N205 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SYNE4Q8N205 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SYNE4Q8N205 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SYNE4Q8N205 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SYNE4Q8N205 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SYNE4Q8N205 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SYNE4Q8N205 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SYNE4Q8N205 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SYNE4Q8N205 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SYNE4Q8N205 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SYNE4Q8N205 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SYNE4Q8N205 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SYNE4Q8N205 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SYNE4Q8N205 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SYNE4Q8N205 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
SYNE4Q8N205 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SYNE4Q8N205 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SYNE4Q8N205 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
SYNE4Q8N205 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SYNE4Q8N205 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SYNE4Q8N205 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SYNE4Q8N205 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SYNE4Q8N205 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SYNE4Q8N205 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SYNE4Q8N205 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SYNE4Q8N205 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SYNE4Q8N205 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SYNE4Q8N205 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SYNE4Q8N205 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SYNE4Q8N205 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SYNE4Q8N205 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SYNE4Q8N205 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SYNE4Q8N205 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SYNE4Q8N205 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SYNE4Q8N205 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
SYNE4Q8N205 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SYNE4Q8N205 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SYNE4Q8N205 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SYNE4Q8N205 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SYNE4Q8N205 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SYNE4Q8N205 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SYNE4Q8N205 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SYNE4Q8N205 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SYNE4Q8N205 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SYNE4Q8N205 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SYNE4Q8N205 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SYNE4Q8N205 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SYNE4Q8N205 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SYNE4Q8N205 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SYNE4Q8N205 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SYNE4Q8N205 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
SYNE4Q8N205 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SYNE4Q8N205 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SYNE4Q8N205 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SYNE4Q8N205 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SYNE4Q8N205 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SYNE4Q8N205 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
SYNE4Q8N205 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SYNE4Q8N205 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SYNE4Q8N205 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SYNE4Q8N205 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SYNE4Q8N205 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SYNE4Q8N205 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SYNE4Q8N205 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms