Protein–RNA interactions for Protein: Q86UC2

RSPH3, Radial spoke head protein 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH3Q86UC2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RSPH3Q86UC2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RSPH3Q86UC2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RSPH3Q86UC2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RSPH3Q86UC2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RSPH3Q86UC2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RSPH3Q86UC2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RSPH3Q86UC2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RSPH3Q86UC2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RSPH3Q86UC2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RSPH3Q86UC2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RSPH3Q86UC2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RSPH3Q86UC2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RSPH3Q86UC2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RSPH3Q86UC2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RSPH3Q86UC2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RSPH3Q86UC2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RSPH3Q86UC2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RSPH3Q86UC2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RSPH3Q86UC2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RSPH3Q86UC2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RSPH3Q86UC2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RSPH3Q86UC2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RSPH3Q86UC2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RSPH3Q86UC2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RSPH3Q86UC2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RSPH3Q86UC2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RSPH3Q86UC2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RSPH3Q86UC2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RSPH3Q86UC2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RSPH3Q86UC2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RSPH3Q86UC2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RSPH3Q86UC2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RSPH3Q86UC2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RSPH3Q86UC2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RSPH3Q86UC2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RSPH3Q86UC2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RSPH3Q86UC2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RSPH3Q86UC2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RSPH3Q86UC2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RSPH3Q86UC2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RSPH3Q86UC2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RSPH3Q86UC2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RSPH3Q86UC2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RSPH3Q86UC2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RSPH3Q86UC2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RSPH3Q86UC2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RSPH3Q86UC2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RSPH3Q86UC2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RSPH3Q86UC2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RSPH3Q86UC2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RSPH3Q86UC2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RSPH3Q86UC2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RSPH3Q86UC2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RSPH3Q86UC2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RSPH3Q86UC2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RSPH3Q86UC2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RSPH3Q86UC2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RSPH3Q86UC2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RSPH3Q86UC2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RSPH3Q86UC2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RSPH3Q86UC2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RSPH3Q86UC2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RSPH3Q86UC2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RSPH3Q86UC2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RSPH3Q86UC2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RSPH3Q86UC2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RSPH3Q86UC2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RSPH3Q86UC2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RSPH3Q86UC2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RSPH3Q86UC2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RSPH3Q86UC2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RSPH3Q86UC2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RSPH3Q86UC2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RSPH3Q86UC2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RSPH3Q86UC2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RSPH3Q86UC2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RSPH3Q86UC2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RSPH3Q86UC2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RSPH3Q86UC2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RSPH3Q86UC2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RSPH3Q86UC2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RSPH3Q86UC2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RSPH3Q86UC2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RSPH3Q86UC2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RSPH3Q86UC2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RSPH3Q86UC2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RSPH3Q86UC2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RSPH3Q86UC2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RSPH3Q86UC2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RSPH3Q86UC2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RSPH3Q86UC2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RSPH3Q86UC2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RSPH3Q86UC2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RSPH3Q86UC2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RSPH3Q86UC2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RSPH3Q86UC2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RSPH3Q86UC2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RSPH3Q86UC2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RSPH3Q86UC2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms