Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00523Q86TU6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00523Q86TU6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00523Q86TU6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00523Q86TU6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00523Q86TU6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00523Q86TU6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00523Q86TU6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC00523Q86TU6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC00523Q86TU6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC00523Q86TU6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC00523Q86TU6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC00523Q86TU6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC00523Q86TU6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC00523Q86TU6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LINC00523Q86TU6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LINC00523Q86TU6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00523Q86TU6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00523Q86TU6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00523Q86TU6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00523Q86TU6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00523Q86TU6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00523Q86TU6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00523Q86TU6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00523Q86TU6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00523Q86TU6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00523Q86TU6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00523Q86TU6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00523Q86TU6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00523Q86TU6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00523Q86TU6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00523Q86TU6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00523Q86TU6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00523Q86TU6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00523Q86TU6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00523Q86TU6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00523Q86TU6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00523Q86TU6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00523Q86TU6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00523Q86TU6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00523Q86TU6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00523Q86TU6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00523Q86TU6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00523Q86TU6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00523Q86TU6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00523Q86TU6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00523Q86TU6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00523Q86TU6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00523Q86TU6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00523Q86TU6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00523Q86TU6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00523Q86TU6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00523Q86TU6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00523Q86TU6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00523Q86TU6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00523Q86TU6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00523Q86TU6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00523Q86TU6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00523Q86TU6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00523Q86TU6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00523Q86TU6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00523Q86TU6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00523Q86TU6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00523Q86TU6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00523Q86TU6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00523Q86TU6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00523Q86TU6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00523Q86TU6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00523Q86TU6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00523Q86TU6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00523Q86TU6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00523Q86TU6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00523Q86TU6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00523Q86TU6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00523Q86TU6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00523Q86TU6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00523Q86TU6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00523Q86TU6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00523Q86TU6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00523Q86TU6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00523Q86TU6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00523Q86TU6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00523Q86TU6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00523Q86TU6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00523Q86TU6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LINC00523Q86TU6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00523Q86TU6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00523Q86TU6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00523Q86TU6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00523Q86TU6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00523Q86TU6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00523Q86TU6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00523Q86TU6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00523Q86TU6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00523Q86TU6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00523Q86TU6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00523Q86TU6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00523Q86TU6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00523Q86TU6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00523Q86TU6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms